研究課題/領域番号 |
17K10578
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研究機関 | 東京大学 |
研究代表者 |
八木 浩一 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (90422310)
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研究分担者 |
瀬戸 泰之 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (00260498)
垣見 和宏 東京大学, 医学部附属病院, 特任教授 (80273358)
松下 博和 東京大学, 医学部附属病院, 特任講師 (80597782)
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研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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キーワード | 食道癌 / 胃癌 / 腫瘍免疫 / 免疫応答 / ネオアンチゲン / イムノグラム / 複合的免疫治療 |
研究実績の概要 |
悪性腫瘍患者では抗腫瘍免疫応答は様々な機序で抑制されている。その抑制因子の一つである免疫チェックポイント分子の阻害薬による治療は、複数のがん種で生存期間の延長を示し、食道癌・胃癌でも複数の国際共同試験が進行中である。さらに他の抑制因子を標的とした薬剤を併用した複合的免疫治療の開発も始まっている。しかし、これらの治療効果を予測するバイオマーカーは確立されていない。本研究では、手術で切除された食道癌・胃癌の組織より腫瘍特異的遺伝子変異由来のネオアンチゲンを同定し、また腫瘍の免疫関連遺伝子の発現を検討して、患者個々の腫瘍内免疫応答の特性を評価した「イムノグラム」を作成する。本研究によって、食道癌・胃癌患者個々の「イムノグラム」に基づいた最適な複合的免疫治療が可能になると期待される。 今年度は、食道癌35例、胃癌26例の検体を収集し、末梢血検体から末梢血単核球(PBMC)と血清を分離して凍結保存した。十分な量の腫瘍組織が採取できた症例については、腫瘍組織を細断し、一部は酵素処理などを行ってFresh tumor digest(FTD)を作成した。残りは培地上に播種し、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)および腫瘍細胞を培養した。そして、得られたTILとFTDを共培養し、上清を回収してELISAでインターフェロンγ(IFNγ)産生を解析した。これらの解析から腫瘍細胞内に腫瘍反応性のTILが存在している症例があることが確認された。 さらに、これらの検体について、次世代シークエンサーによる解析のための準備を行い、一部について、腫瘍組織の肉眼的な癌部と非癌部、PBMCからそれぞれDNA,RNAを抽出し、全エクソン、全RNAシーケンス解析を外注に出した。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
初年度から順調に検体の収集が進んでおり、第一段階の解析として、食道癌・胃癌においても、腫瘍細胞内に腫瘍反応性のTILが存在している症例があることが確認できた。また、一部の検体は次世代シークエンサーによる全エクソン、全RNAシーケンス解析を外注に出し、残りの検体も、次世代シークエンサーによる解析のための準備を行っている。
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今後の研究の推進方策 |
全エクソン、全RNAシーケンスを行い、MHCクラスI/II結合予測法を用いて、腫瘍特異的遺伝子変異由来のネオアンチゲンを同定する。さらに、全RNAシーケンスを行って得られた遺伝子発現プロファイリングなどから、腫瘍内微小環境の解析を行う。これらから、患者毎の抗腫瘍免疫応答を抑制している因子について、「イムノグラム」を作成し、複合的免疫治療の可能性を検討する。
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次年度使用額が生じた理由 |
次年度には、今年度未提出の検体に加え、新たに収集した検体を、次世代シークエンサーによる全エクソン、全RNAシーケンス解析を外注することをを予定しているため。
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