大腸癌の予後に関連するnon-cording RNA FTXに関する検討

2019 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 17K10646
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 岩手医科大学
• 研究代表者: 秋山 有史 岩手医科大学, 医学部, 講師 (10405798)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2020-03-31
• キーワード: 大腸癌 / noncoding RNA / FTX

研究成果の概要

FTXはX染色体の不活化を誘導するXISTの近傍Xq13.2に存在するlong intervening (intergenic) noncoding RNA である。大腸癌組織では正常組織に比較し有意にFTX mRNA発現が高く、FTX 高発現患者は低発現患者に比べ有意に予後不良であり、大腸癌悪性度に関連することが示唆された。大腸癌原発巣の３か所より組織採取し、網羅的遺伝子変異解析・タンパク発現解析を行い腫瘍内heterogeneityを明らかにし、これとFTX発現を比較するシステムを構築した。digital PCRでは微量発現検出さららに部位別の発現差も確認可能であった。

自由記述の分野

消化器外科

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では大腸癌原発巣のmulti region samplingを行い、次世代シークエンサーによる遺伝子変異解析、逆相タンパクライセートアレイによるタンパク発現解析を行い、これらの問題点を考察した。少数か所のsampling、比較的少数の変異でも進化過程の初期に生じたtrunk mutationと後期に加わってきたと考えられるbranch mutationと時間的情報を確認でき、これに対応するRNA/タンパク発現を評価することができた。また予後不良大腸癌で異常を示すnoncoding RNAであるFTXを対象としてdigital PCRを用いたmRNA微量発現を定量するシステムを構築した。