| 研究課題/領域番号 |
17K10784
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
呼吸器外科学
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| 研究機関 | 岡山大学 |
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研究代表者 |
冨田 秀太 岡山大学, 大学病院, 准教授 (10372111)
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| 研究分担者 |
豊岡 伸一 岡山大学, 医歯薬学総合研究科, 教授 (30397880)
宗 淳一 岡山大学, 大学病院, 講師 (90559890)
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| 研究期間 (年度) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | 分子バーコード / 次世代シーケンサー / 遺伝子変異解析 / 非小細胞肺癌 / EGFR / ALK |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、分子バーコード技術を用いた次世代シーケンサー（分子バーコードNGS）解析手法の有用性を検討した。技術的再現性を確認した後、上皮成長因子受容体（EGFR）変異陽性の肺腺がん64症例を解析したところ、7症例において、E709G/K、D761Y、G598V、R776Hの副たるEGFR遺伝子変異の複合変異（compound mutation）を検出した。また、治療に抵抗性を示したALK融合遺伝子陽性の肺腺癌症例を対象に、治療前と治療後の試料の解析を実施した。治療前のサンプルからはALK融合遺伝子を検出し、治療後のサンプルからALK阻害剤に耐性を示す遺伝子変異を高感度に検出した。
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| 自由記述の分野 |
バイオインフォマティクス
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
EGFRのG719Xを有する症例で統計学的に有意に複合変異（compound mutation）が検出されることが分かった。またTCGAのPan-Lung cancerデータセットから660症例の肺腺癌症例を抽出・解析したところ、同様の傾向が確認されたことから、G719X遺伝子変異陽性の肺腺癌症例に対する診断への応用が期待される。
ALK阻害剤治療に耐性を示し、急激に増悪した症例のサンプルの解析を実施したところ、治療後のサンプルからはALK阻害剤への耐性を示すALK G1202R変異を引き起こす遺伝子変異が検出されており、ALK融合遺伝子陽性の肺腺癌症例に対する診断への応用が期待される。
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