研究課題
我々はマウス ES細胞とiPS細胞から安定した株化網膜前駆細胞を樹立した。そのうちの一部の細胞株は視細胞前駆細胞としての性質を持ち、ケモカインSDF1に反応して優先的に杆体視細胞、MCP1に反応して優先的に錐体視細胞へと分化する。その分化機構を転写因子レベルとエピジェネティック調節のレベルで解析した。種々の濃度のSDF1を添加して、経時的に細胞株を回収後、次世代シークエンサーを用いて各細胞の全転写パターンを分析した。同様にMCP1を添加した培養系も作成して同様に解析した。 得られたデータをKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) databaseを対象にiPathwayGuideを用いたBioinformaticな解析を行った。具体的にはq valueの閾値を1として(cut off無しで)多変量解析法を実施した。その結果、非刺激状態に比較してSDF1刺激ではThyroid hormone synthesis経路が活性化されていることが示された。これまでに視細胞前駆細胞からの杆体視細胞への分化にはThyroid hormone Receptorβ以下の経路が重要に関わることが知られているが、我々の成績はThyroid hormone synthesis経路と Thyroid hormone Receptorβ以下の経路の両者が視細胞分化に必要な事を示している。同様の解析の結果からSuperoxide dismutase (SOD)1と抗アポトーシス蛋白Bcl-2が関わるAmyotrophic lateral sclerosis (ALS)経路も視細胞分化に必要な事が示された。 現在、これらとは別の代謝経路に関する解析は進行中であり、今後の進展が待たれる。
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