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2017 年度 実施状況報告書

超高速ゲノム解読に基づく骨格性下顎前突症感受性候補遺伝子の探索

研究課題

研究課題/領域番号 17K11949
研究機関福岡歯科大学

研究代表者

梶井 貴史  福岡歯科大学, 口腔歯学部, 准教授 (60322822)

研究分担者 岡 晃  東海大学, 総合医学研究所, 講師 (80384866)
八田 光世  福岡歯科大学, 口腔歯学部, 准教授 (30344518)
研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワードエクソーム解析 / 骨格性下顎前突症
研究実績の概要

ゲノムワイド関連解析では骨格性下顎前突症の強いリスクを伴う感受性候補遺伝子を突き止めることができなかった。そこで大家系を用いた全エクソーム解析により遺伝子機能に影響を与える原因変異を探索し、最終的には成長期の骨格性下顎前突症患者で将来外科手術が必要となるか否かを、成長期のうちに確定診断できるようにするることが本研究の目的である。
大家系(同一家系に14個体の骨格性下顎前突症罹患者)を用いた全エクソーム解析を行う前に、本年度はまず、4世代にわたる15個体から成る家系(うち罹患者5個体)を用いた全エクソーム解析を行った。罹患者4名、非罹患者5名のゲノムDNAからSureSelect v6+UTRsキットを用いてエクソームライブラリを調整し、次世代シークエンサーを用いてこのライブラリをシークエンスした。
その結果、罹患者4名の全てに認められ、非罹患者5名のいずれにも認められなかったエクソン領域の変異は、16個であった。この変異は、UBASH3B遺伝子、BEST3遺伝子、ARSD遺伝子上のエクソン領域上に存在していた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

大家系からのゲノムDNAサンプルはまだ得られていないものの、中規模の1家系からの全エクソーム解析を研究期間1年目にして既に行うことができたため。

今後の研究の推進方策

今年度に得られた全エクソーム解析の結果を、遺伝子連鎖解析を行うことにより追試する。また、大家系からのゲノムDNAサンプルの採取を引き続き行っていく。

次年度使用額が生じた理由

執行率98.9%と、ほぼ全額を使用した。
次年度には試薬等の消耗品を引き続き購入するので、その費用として用いる。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Candidate gene analysis of mandibular prognathism2017

    • 著者名/発表者名
      Kajii TS, Oka A
    • 雑誌名

      Journal of Dentistry and Oral Biology

      巻: 2 ページ: Article1068

    • DOI

      https://pdfs.semanticscholar.org/9504/38a12862cce414e7cdb01b6b63a1d3eb44d6.pdf

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide association study for mandibular prognathism using microsatellite and pooled DNA method2017

    • 著者名/発表者名
      Saito F, Kajii TS, Oka A, Ikuno K, Iida J
    • 雑誌名

      American Journal of Orthodontics and Dentofacial Orthopedics

      巻: 152 ページ: 382-388

    • DOI

      10.1016/j.ajodo.2017.01.021

    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] The function of PLXNA2, which was suggested to be candidate genes by genome-wide association study for mandibular prognathism, on chondrocytes2018

    • 著者名/発表者名
      Kajii TS, Oka A, Iida J, Hatta M, Yamazaki J, Yamashita J, Tamaoki S
    • 学会等名
      11th Asian Pacific Orthodontic Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] Genome-wide association study for mandibular prognathism using microsatellite2017

    • 著者名/発表者名
      Kajii TS
    • 学会等名
      Translational Research Meeting with Dr. Thesleff at Fukuoka Dental College
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-12-17  

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