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2018 年度 実績報告書

CRISPRスクリーニングによるがん微小環境下での浸潤関連遺伝子の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 17K15045
研究機関広島大学

研究代表者

中出 翔太  広島大学, 理学研究科, 研究員 (70795509)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
キーワードゲノム編集 / CRISPR-Cas9 / ノックイン / スクリーニング
研究実績の概要

スクリーニングの基盤整備のためゲノム編集を効率化させる新規技術を開発し、Local Accumulation of DSB repair molecules (LoAD)と命名した。これは、ゲノム編集を適用する領域にDNA修復因子を効果的に集積させることによって、目的の遺伝子改変効率を上昇させる技術である。同法の開発によって、培養細胞における正確な遺伝子挿入(ノックイン)効率の上昇や、同時多重ノックインの実用化、さらに小規模な塩基欠失を優先的に誘導することが可能になった。またこれらの成果については、筆頭著者として論文をNature Communications誌に発表を行なった。
本研究に用いる乳がん細胞株は遺伝子導入効率が低かったが、LoAD法の開発によってスクリーニングに関連した改変細胞を効率的に樹立する環境整備が完了したので、続いてスクリーニングに使用するウィルスベクターの乳がん細胞株における遺伝子導入効率について評価及びCas9タンパク質を恒常的に発現する乳がん細胞株の作製を実施した。
まず、乳がん細胞であるMCF7とMDA-MB-231におけるsgRNAライブラリー及びCas9恒常発現株作製用のレンチウィルスベクターの力価評価を行った。これについては、ウィルスベクターを導入した乳がん細胞に最適な抗生物質を処理し、生存細胞の数を測定および比較することによって実施した。また算出した力価に従ってCas9恒常発現用ベクターを乳がん細胞株に導入し、Cas9タンパク質恒常発現株を作製した。以上の成果により、スクリーニングに関連した環境整備が完了した。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2018 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Biased genome editing using the local accumulation of DSB repair molecules system2018

    • 著者名/発表者名
      Nakade Shota、Mochida Keiji、Kunii Atsushi、Nakamae Kazuki、Aida Tomomi、Tanaka Kohichi、Sakamoto Naoaki、Sakuma Tetsushi、Yamamoto Takashi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 3270 ページ: 1 - 10

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41467-018-05773-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Parallel generation of multiplex knock-in cell collections using CRISPR-Cas9 assisted by locally enhanced MMEJ.2018

    • 著者名/発表者名
      Nakade Shota、Mochida Keiji、Kunii Atsushi、Nakamae Kazuki、Aida Tomomi、Tanaka Kohichi、Sakamoto Naoaki、Sakuma Tetsushi、Yamamoto Takashi
    • 学会等名
      FASEB Science Research Conference 2018
    • 国際学会
  • [学会発表] Biased genome editing using the LoAD (local accumulation of DSB repair molecules) system.2018

    • 著者名/発表者名
      Nakade Shota、Mochida Keiji、Kunii Atsushi、Nakamae Kazuki、Aida Tomomi、Tanaka Kohichi、Sakamoto Naoaki、Sakuma Tetsushi、Yamamoto Takashi
    • 学会等名
      CHSL meeting 2018, Genome Engineering: The CRISPR/Cas Revolution.
    • 国際学会
  • [学会発表] LoADシステム:ゲノム編集において任意のDSB修復経路を誘導する汎用的手法2018

    • 著者名/発表者名
      中出翔太、持田圭次、中前和恭、相田知海、田中光一、坂本尚昭、佐久間哲史、山本卓
    • 学会等名
      第三回ゲノム編集学会
  • [備考] 広島大学 分子遺伝学研究室

    • URL

      http://www.mls.sci.hiroshima-u.ac.jp/smg/index.html

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公開日: 2019-12-27  

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