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2019 年度 実績報告書

細胞配置換えの速度と方向を決定する分子・力学メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K15125
研究機関京都大学

研究代表者

杉村 薫  京都大学, 高等研究院, 特定拠点准教授 (50466033)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワード形態形成 / 細胞配置換え / 力学 / 統計推定
研究実績の概要

上皮組織が正しい形態に成長するためには、細胞配置換えの方向や速度が精緻に制御される必要がある。細胞配置換えの速度は上皮組織により10倍も異なるにも 関わらず、その制御機構はほとんど研究されてこなかった。本研究では、「力」と「変形」をつなぐ「機械物性」を調べることで、細胞配置換えの速度と方向を決定する分子・力学メカニズムを解明することを目指す。
本研究ではこれまでに、画像データからCell Vertex Model (CVM) のモデル(構成式)とパラメータを包括的に推定する手法を構築し、パーフェクトモデル実験により、要約統計量を用いた従来手法と比較して推論の精度が格段に向上することを確認していた。
2019年度はまず、赤池情報量規準によるモデル選択を実装し、パーフェクトモデル実験で動作を確認した上で、ショウジョウバエ上皮組織に適用した。その結果、全てのデータで、CVMの典型的なモデルではなく、細胞接着面張力が辺長に負に依存する負のバネ弾性モデルが選択されることがわかった。次に、誤差共分散行列やモンテカルロ法を用いた誤差解析により、ショウジョウバエ上皮組織データにおけるパラメータ推定値が妥当なレベルの信頼度を持つことを確認した。以上から開発手法の有用性が示されたので、開発手法を用いて、ショウジョウバエ上皮組織における機械物性と細胞配置換えの関係を解析した。モデル選択とパラメータ推定の結果は、細胞接合部の負のバネ定数の異方性が細胞配置換えにおける細胞接着面収縮の速度と方向を支配することを示唆していた。現在、この仮説を検証するためのCVMの数値計算に取り組んでいる。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] スルボンヌ大学(フランス)

    • 国名
      フランス
    • 外国機関名
      スルボンヌ大学
  • [雑誌論文] 組織変形の定量化手法と多階層連続体モデル2020

    • 著者名/発表者名
      石原 秀至, 杉村 薫.
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 60 ページ: 37-43

    • DOI

      https://doi.org/10.2142/biophys.60.037

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 細胞と組織をつなぐ新しいクラスの連続体モデル2019

    • 著者名/発表者名
      杉村 薫, 石原 秀至
    • 雑誌名

      生体の科学

      巻: 70 ページ: 333-338

    • DOI

      https://doi.org/10.11477/mf.2425201009

  • [学会発表] アクチン細胞骨格系を中心とした細胞配置換え制御メカニズムの解明2019

    • 著者名/発表者名
      井川 敬介、杉村 薫
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会
  • [学会発表] 細胞配置換え過程におけるアクチン脱重合因子を介した力感知・力抵抗機構2019

    • 著者名/発表者名
      杉村 薫、井川 敬介
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] The mechanics of nature behind the multicellular tissue structure2019

    • 著者名/発表者名
      杉村薫
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
  • [備考] 京都大学高等研究院物質-細胞統合システム拠点杉村グループウェブサイト

    • URL

      http://www.koolau.info/

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公開日: 2021-01-27  

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