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底生性渦鞭毛藻は海藻表面や砂浜の砂の間隙、タイドプールなどに生息し、形態・生理・生態の多様な幅広い系統が存在する。遊泳性渦鞭毛藻に比べると研究の歴史が長くないことから、底生性渦鞭毛藻の分子系統学的情報は遊泳性渦鞭毛藻のものより乏しいと言える。渦鞭毛藻類の進化過程を明らかにするためには、底生性渦鞭毛藻の形態情報および分子系統学的情報を蓄積していくことが必要である。本研究は底生性渦鞭毛藻のうち、セルロース質の殻（鎧板）をもつ有殻種を中心としてその多様性と系統関係を解明することを目的とした。本年度は、沖縄県の砂サンプルの粗培養株から発見した有殻の従属栄養性底生渦鞭毛藻の代表的な属であるアンフィディニオプシス属の新種について、同属の既存種および地理的に異なる砂浜の砂から採集した同じく新種と考えられる標本との詳細な形態比較をおこない、これらの結果のまとめと記載を進めた。また、本研究の総まとめとして、現時点で得られる全てのアンフィディニオプシス属種のデータと、近縁性があると考えられるプランクトン性渦鞭毛藻プロトペリディニウム科の各種や底生性渦鞭毛藻ヘルドマニア属を中心とした渦鞭毛藻類の分子系統学的解析を核コード18S rDNA配列と28S rDNA配列を用いて遂行し、得られた結果と対象種の形態的特徴を照合させて分類学的検討をおこなった。その結果、アンフィディニオプシス属の各系統グループとプロトペリディニウム科に属する一部のサブグループおよびヘルドマニア属が互いに入り組みクレードを形成し、アンフィディニオプシス属自体は単系統性を示さなかった。また、本研究で得られたアンフィディニオプシス属の2新種の形態的特徴はHoppenrathら(2014)にて提案された3番目の形態グループ（形態グループ3）に該当するが、本研究にて分子系統学的解析に含んだ他の形態グループ3の種とは異なる系統であることが分かった。
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