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2017 年度 実施状況報告書

絶滅したニホンカワウソの博物館標本から解き明かす系統分類と集団形成史

研究課題

研究課題/領域番号 17K15177
研究機関東京農業大学

研究代表者

和久 大介  東京農業大学, 農学部, 助教 (60793578)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワードニホンカワウソ / 博物館標本 / 対馬
研究実績の概要

平成29年度は、新たな試料収集と対馬で発見されたカワウソのDNA解析をおこなった。北海道の試料については、新たに1試料を収集した。これにより、北海道産のニホンカワウソLutra lutra whiteleyiと考えられる試料数が増え、北海道集団の系統解明に期待が持てるようになった。現状では、北海道産2個体、本州産5個体、四国産4個体分の試料を収集したことになる。加えて、北海道、四国で新たにニホンカワウソ標本の所蔵情報を得た。これらの標本からサンプリングができれば北海道産個体が3個体以上に、四国産も5個体以上にできる。このように、当初の予定よりも多くの試料を収集できる可能性があり、今後の解析においてコンタミネーションが激しく解析できない個体が出たとしても他の個体にエフォートを充て解析することで、それぞれの地域の系統を明らかにすることができるだろう。
また、当該年度には対馬でカワウソが発見された。本研究の実施者もこのカワウソの正体を明らかにすべく、調査・検証に携らせていただいた。対馬で採取されたカワウソの糞からミトコンドリアDNA配列を決定し、分子系統樹を推定した。その結果は環境省の記者会見で発表され、報道資料としてホームページ上で公表されている。対馬のカワウソは系統樹上で韓国・サハリン系統であった。この結果は、対馬の動植物の多くが韓国など大陸の系統であることと矛盾しない結果だった。今回の対馬での発見は日本列島におけるカワウソ集団の形成史を解き明かす上で、非常に意義深いものとなっている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

平成29年度は対馬でカワウソが発見され、その調査や検証にエフォートを割いた。当初計画では剥製標本等の試料から次世代シーケンサーによる解析を予定していたが、本研究で試料を収集できていなかった対馬(九州)から試料を入手し、解析できたことは重要な進展である。また、次世代シーケンサーの解析についても、剥製標本等の試料をまとめて解析するため、大きな障壁ではない。

今後の研究の推進方策

新たに所蔵を確認したニホンカワウソ標本からの試料収集を進める。各地域で3個体以上の試料を目標とする。目標個体数を確保し次第、次世代シーケンサーでの解析に移る。以降は当初の計画通り、抽出したDNAから直接DNAライブラリを作成し、次世代シーケンサーで解析する。十分なリード数を得られた試料は以降の解析から外す。十分なリード数を得られなかった試料はカスタムビーズを用いて、目的のDNAをキャプチャし、キャプチャしたDNAからDNAライブラリを作成・解析する。

次年度使用額が生じた理由

平成29年度は対馬で発見されたカワウソのDNA解析にエフォートを割いた。このことから当初予定していた次世代シーケンサーによる博物館標本の試料解析を行わなかった。これはエフォート面もあるが、コンタミネーションを避けるためにも重要な事柄であった。一方で、この遅れは十分に取り戻せるもので、平成30年度以降に当初の予定通り実験を進めていく。このため、次年度使用額が生じた。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2018 2017

すべて 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [学会発表] 群馬県ツキノワグマのマイクロサテライト遺伝子座を用いた集団構造解明へ2018

    • 著者名/発表者名
      和久大介・佐々木剛・谷本真樹・米澤隆弘・姉崎智子
    • 学会等名
      ぐんまの自然の「いま」を伝える報告会 2017
  • [学会発表] 2010年から2012年の群馬県 ツキノワグマのミトコンドリアDNA部分配列 に基づいた遺伝的集団構造の動態2017

    • 著者名/発表者名
      和久大介・米澤隆弘・中野敬太・姉崎智子
    • 学会等名
      日本哺乳類学会2017年度大会
  • [学会発表] 日本に生息していたカワウソの分類2017

    • 著者名/発表者名
      和久大介
    • 学会等名
      農大動物研究会
    • 招待講演
  • [図書] 月刊科学雑誌Newton 2017年11月号2017

    • 著者名/発表者名
      井上達彦
    • 総ページ数
      160
    • 出版者
      株式会社ニュートンプレス
    • ISBN
      070471117

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公開日: 2018-12-17  

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