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2017 年度 実施状況報告書

プロモーターから発現するlncRNAによるcyclin D1遺伝子の発現制御機構

研究課題

研究課題/領域番号 17K18065
研究機関埼玉医科大学

研究代表者

米田 竜馬  埼玉医科大学, 医学部, 助教 (00734881)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2020-03-31
キーワードRNAメチル化 / TLS/FUS / pncRNA / m6A
研究実績の概要

本研究の目的はlong noncoding RNAによるCCND1遺伝子の発現制御メカニズムを解明することである。平成29年度は、研究計画に従い①メチル化したpncRNA-D断片6とTLSとの結合、②pncRNA-Dのm6A修飾を認識するリーダータンパク質の決定、③修飾酵素であるMETTL3とリーダータンパク質のノックダウンによる影響、を検証した。
①については、m6A修飾を受けていると考えられる配列(GGACU)を中心に、20ntの長さのRNAを合成し、m6A修飾を入れたものと入れていないRNAを用意した。それぞれ5’側をbiotin標識しており、強制発現させたTLSとの結合を見た。その結果、m6A修飾単体ではTLSとの結合が強まることを明らかにした。
②については、候補であったYTHDF1, 2, YTHDC1, hnRNP-A2B1の抗体を用いたRNA免疫沈降法によりYTHDC1が主にpncRNA-Dのm6A修飾を認識していることを明らかにした。
③についてはMETTL3と②で同定したYTHDC1を、siRNAを用いてノックダウンした。METTL3のノックダウンではpncRNA-Dの発現量が上がり、さらに安定性が上昇した。YTHDC1のノックダウンはRNAの安定性には関与していなかったが、METTL3のノックダウンとともにTLSとの結合が強まった。
以上より、m6A修飾がpncRNA-Dの安定性とTLSとの結合に関与していることを明らかにしたので、平成30年度はpncRNA-Dが通常の細胞周期にも関与しているか、に着目して研究を進める。また細胞ストレスにより誘導されるpncRNA-D自体の転写調節機構についても研究を進める。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

平成29年度の研究計画に従い、①ではpncRNA-Dのメチル化の有無によるTLSとの結合強度の違いを、②ではpncRNA-Dのm6A修飾を認識するリーダータンパク質がYTHDC1であることを同定した。③についてはMETTL3とYTHDC1のノックダウンによりpncRNA-DとTLSとの結合が強まることを明らかにした。当初計画していた研究項目を達成できたため、(2)の評価とした。

今後の研究の推進方策

今後はsiRNAによりYTHDC1やMETTL3をノックダウンすることで、細胞周期にどのような影響が出るのかを検証する。また、pncRNA-Dによる細胞周期への影響を確認するため、細胞分裂や増殖が促進しているのかを検証する。今までの実験ではHeLa細胞を用いて研究を進めてきたので、今後は肺がんや乳がん由来の細胞株であるA549やMCF7を用いて、同様の実験を行う予定である。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2017

すべて 学会発表 (2件)

  • [学会発表] TLS and long noncoding RNA transcribed from the promoter of cyclin D1 repress its mRNA expression2017

    • 著者名/発表者名
      Ryoma YONEDA, Wei Cui, Naomi Ueda, Riki Kurokawa
    • 学会等名
      第43回内藤コンファレンス
  • [学会発表] The effect of m6A modification on lncRNA transcribed from Cyclin D1 promoter2017

    • 著者名/発表者名
      Ryoma YONEDA, Wei CUI, Naomi UEDA, and Riki KUROKAWA
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)

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公開日: 2018-12-17  

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