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2018 年度 実績報告書

遺伝子転写活性とゲノム三次元構造の経時的同時計測による発現制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K18363
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

有吉 哲郎  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員 (00782103)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2019-03-31
キーワードRNA / イメージング / ゲノム / 技術開発
研究実績の概要

前年度までに確立した「新規蛍光Romanescoと蛍光寿命イメージングの組み合わせによる生細胞RNAイメージング技術」を用いて内在性遺伝子転写活性のライブセルイメージングを行うため、本年度はまずRomanescoが内在性遺伝子の3'UTR領域にノックインされたセルラインを作製した。外部刺激に応答して誘導される転写活性をイメージングにより可視化し、細胞集団レベルでの転写動態を解析したところ、これまでの知見と一致する周期的な転写活性化が観察された。さらに単一細胞レベルでの転写動態を解析したところ、集団で見られたのと同様の周期的活性化が個々の細胞についても起こることが見出された。これは本研究計画において確立されたライブセルRNAイメージング技術によって初めて明らかとなった新たな知見である。
さらに、ゲノム構造を可視化可能な蛍光色素とRomanescoの同時イメージングを行った。外部刺激によりゲノム構造がゆるやかに変化する様子が観察されたが、内在性遺伝子の転写活性化はゲノム構造の変化に先立って起こった。すなわち、ある種の遺伝子はゲノム立体構造の変化を伴わずに転写活性化しうることが明らかとなった。
また、開発した新技術を用いることで、遺伝子発現過程における転写産物の核内微細構造への局在化イメージング、細胞質RNAのストレス顆粒への移行動態解析、神経細胞におけるリボ核タンパク質輸送動態のイメージングにも成功した。
以上の研究実績により、本研究計画で目標としていた「遺伝子転写活性とゲノム三次元構造の経時的同時計測」が無事達成された。今後本研究計画で得られた成果を元に、遺伝子転写活性化機構の詳細やRNA局在化によるタンパク質発現の制御機構について研究を発展させて行きたいと考えている。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] A Highly Photostable Near-Infrared Labeling Agent Based on a Phospha-rhodamine for Long-Term and Deep Imaging2018

    • 著者名/発表者名
      Marek Grzybowski, Masayasu Taki, Kieko Senda, Yoshikatsu Sato, Tetsuro Ariyoshi, Yasushi Okada, Ryosuke Kawakami, Takeshi Imamura, and Shigehiro Yamaguchi
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 57(32) ページ: 10137-10141

    • DOI

      10.1002/anie.201804731

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Tips on live-cell super-resolution microscopy and its application in RNA imaging2019

    • 著者名/発表者名
      有吉哲郎、岡田康志
    • 学会等名
      第92回日本薬理学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] Genetically-encoded fluorogenic RNA for imaging spatiotemporal mRNA dynamics at subcellular resolution2018

    • 著者名/発表者名
      有吉哲郎、岡田康志
    • 学会等名
      第70回日本細胞生物学会・第51回日本発生生物学会合同大会
  • [学会発表] Visualizing spatiotemporal mRNA dynamics at subcellular resolution with a bright fluorogenic RNA2018

    • 著者名/発表者名
      有吉哲郎、岡田康志
    • 学会等名
      2018 ASCB | EMBO Meeting
    • 国際学会 / 招待講演
  • [産業財産権] 蛍光発生核酸分子、及び標的RNAの蛍光標識方法2018

    • 発明者名
      有吉哲郎、岡田康志
    • 権利者名
      有吉哲郎、岡田康志
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2018-226743

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公開日: 2019-12-27  

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