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2018 年度 実施状況報告書

かぎりなくタンパク質に優しい高速原子間力顕微鏡の開発

研究課題

研究課題/領域番号 17K19042
研究機関福岡大学

研究代表者

山本 大輔  福岡大学, 理学部, 教授 (80377902)

研究分担者 武藤 梨沙  福岡大学, 理学部, 助教 (10622417)
研究期間 (年度) 2017-06-30 – 2020-03-31
キーワード走査プローブ顕微鏡 / ナノバイオ / 蛋白質 / 原子間力顕微鏡
研究実績の概要

高速原子間力顕微鏡測定において、探針から試料に与える擾乱を限りなく低減させるための測定法の開発を行った。昨年度までに明らかになった、本測定法において高速原子間力顕微鏡のフィードバック制御が不安定になる原因を特定した。この知見をもとに信号検出システムならびに高速原子間力顕微鏡装置の構成を一部見直すことで、大幅にフィードバック制御の安定性を向上させることができた。これにより、硬いマイカ基板のみならず、柔軟なタンパク質に対しても安定的に測定を行うことが可能となった。本測定法を用いて、ダブルリング構造を形成するタンパク質であるGroELの測定を行った。通常のタッピングモードによる高速原子間力顕微鏡測定では、GroELのダブルリング構造を保ったまま長時間測定することが困難であったのに対して、本手法による測定では、GroELのダブルリング構造を破壊することなく長時間測定することが可能であった。この結果は本測定法においては探針から試料に与える擾乱が従来の方法と比較して非常に少ないことを意味し、本測定法がタンパク質測定に対して有効性が高いことが示唆された。一方で、本測定法では高速原子間力顕微鏡のフィードバック速度が従来のタッピングモードと比較して低く、1 frame/sec以上の高速測定は現状では困難であることが分かった。また、昨年度までに計算で得られた探針と試料との間に働く力の値が妥当であるか検証するため、シミュレーションにより得られたカンチレバーの応答信号特性と実際のカンチレバーの応答信号特性を比較した。この結果、両者の間で信号応答特性にずれが認められるものの、大まかには類似していることがわかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

信号検出システムならびに高速原子間力顕微鏡装置を一部見直すことで、大幅に測定の安定性を向上させることができた。これによって高速原子間力顕微鏡測定に対して脆弱なタンパク質であるGroELを長時間安定に測定することに成功したため。

今後の研究の推進方策

GroELのみならずさまざまなタンパク質分子を測定し、本測定法が多くのタンパク質の1分子ナノ構造測定に対して有効性が高いことを示す。また、高速原子間力顕微鏡測定におけるフィードバック速度が本測定法において低下する原因を特定し、高速化への方向性を探る。

次年度使用額が生じた理由

本年度は高速原子間力顕微鏡フィードバックの安定性の向上に注力し、カンチレバーの消耗が少なかったため、本年度中に全額を使用しなかった。次年度はタンパク質試料の測定を多く行う予定であるため、試料作製のための消耗品やカンチレバーなどの購入に使用する計画である。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2019 2018

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Electron transport pathways in isolated chromoplasts from Narcissus pseudonarcissus L.2019

    • 著者名/発表者名
      Grabsztunowicz Magda、Mulo Paula、Baymann Frauke、Mutoh Risa、Kurisu Genji、Setif Pierre、Beyer Peter、Krieger‐Liszkay Anja
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: - ページ: -

    • DOI

      10.1111/tpj.14319

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] X-ray structure of an asymmetrical trimeric ferredoxin-photosystem I complex2018

    • 著者名/発表者名
      Kubota-Kawai Hisako、Mutoh Risa、Shinmura Kanako、Setif Pierre、Nowaczyk Marc M.、Rogner Matthias、Ikegami Takahisa、Tanaka Hideaki、Kurisu Genji
    • 雑誌名

      Nature Plants

      巻: 4 ページ: 218~224

    • DOI

      10.1038/s41477-018-0130-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ホウレンソウ由来ストロマラメラに内在するF0 c-リングの原子間力顕微鏡による観察2018

    • 著者名/発表者名
      山本大輔、武藤梨沙
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
  • [学会発表] 光化学系I-フェレドキシン複合体の構造解析2018

    • 著者名/発表者名
      武藤梨沙
    • 学会等名
      NMR若手研究会
    • 招待講演
  • [学会発表] X-ray structure of the type-I reaction center from Heliobacterium modesticaldum at 3.2 Å resolution2018

    • 著者名/発表者名
      T. Nakaniwa, R. Mutoh, K. Fushimi, A. Yasuda, T. Mizoguchi, H. Tamiaki, C. Azai, H. Tanaka, S. Itoh, H. Oh-oka, G. Kurisu
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • 招待講演

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公開日: 2019-12-27  

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