| 研究課題/領域番号 |
17K19248
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| 研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
農芸化学およびその関連分野
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| 研究機関 | 国立遺伝学研究所 |
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研究代表者 |
有田 正規 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (10356389)
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| 研究分担者 |
川島 武士 国立遺伝学研究所, 情報研究系, 助教 (10378531)
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| 研究期間 (年度) |
2017-06-30 – 2021-03-31
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| キーワード | バイオインフォマティクス / 比較ゲノム / 微生物 |
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| 研究成果の概要 |
公共データベースより公開されるピロリ菌ゲノムを比較して、地域に特有あるいは世界で共通するゲノム構造の変化（リアレンジメント）を明らかにした。ゲノム構造の観点からリファレンスとなる株を見つけ、基準となる遺伝子の並びを見出した。
また公開されるビフィズス菌ゲノムから糖代謝に関わる遺伝子を網羅的に探索し、菌の宿主となる動物が食べる食事とビフィズス菌の多糖代謝能との関係を見出した。
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| 自由記述の分野 |
バイオインフォマティクス
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
公共データベースには多種多様な微生物のゲノムが公開されており、同じ種であっても含まれる遺伝子の内訳が菌株毎に数百も異なりうる。そのように類似したゲノムが数百以上あたえられた際、それらを効率よく比較して共通する機能や特徴を見出す作業は「種とはなにか」「なぜ種にわかれるのか」を考える上で重要である。その具体例として、ゲノム構造を比較したり糖代謝能を比較する方法論を見出し、実データに応用した。
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