| 研究課題/領域番号 |
17K19359
|
|---|
| 研究機関 | 東海大学 |
|---|
研究代表者 |
上田 真保子 東海大学, マイクロ・ナノ研究開発センター, 特定研究員 (60760353)
|
|---|
| 研究分担者 |
三橋 里美 横浜市立大学, 医学部, 助教 (40466222)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2017-06-30 – 2020-03-31
|
| キーワード | RNA-seq / 細胞融合 / 筋細胞 / 破骨細胞 / 内在性レトロウイルス / レトロトランスポゾン |
|---|
| 研究実績の概要 |
ERVは、過去に生殖細胞に感染し、宿主ゲノムの一部となったウイルスに由来する配列である。その多くは、機能のないジャンクDNAと考えられているが、ウイルスの膜タンパク遺伝子(env)に由来するERVは、膜融合能を持つことが知られる。実際、一部のenv由来の遺伝子は、細胞融合を担い、哺乳類の胎盤形成に関与している。しかし、胎盤以外の融合細胞である、筋細胞や破骨細胞では、融合に直接かかわる遺伝子はよくわかっていない。このような背景のもと、独自開発したERVのORFアノテーションデータを用い、マウスの筋細胞および破骨細胞の初代培養細胞のRNA-seq解析をおこなった。これまでの予備的な発現解析と比較しても、再現性のある結果がえられており、解析はおおむね順調に進行している。また、一部の結果を分子生物学会（ConBio2017）にて発表した。
|
| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
マウスの筋細胞および破骨細胞の、初代培養細胞をもちいてRNA-seq解析を実施した。サンプル調整やクオリティチェック等に時間がかかり、RNA-seqの実施は、当初の予定より遅れてしまった。新しく得られたRNA-seqデータに関しては、これまでの公共データをつかった予備的な発現解析と同じ候補配列がいくつか特定されており、順調に進捗していると考えている。これらの発現解析はほぼ完了しており、現在は、細胞学的な手法をもちいた、候補配列の細胞内局在を調べる準備をしているところである。
|
| 今後の研究の推進方策 |
現在、得られた候補配列の機能実験をおこなう準備をしている。結果がえられ次第、配列比較解析に取りかかる予定である。
|
| 次年度使用額が生じた理由 |
RNA-seqを実施するにあたり、価格の安い会社に外注したことで金額が多少あまったことと、RNA-seqの実施が遅れたことで、その後の実験計画に遅れが生じたため。
|
