2019 年度研究成果報告書

包括的ゲノム解析によるノロウイルス新変異株の河川水と患者における早期検出系の構築

研究課題

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研究課題/領域番号	17K19874
研究種目	挑戦的研究(萌芽)
配分区分	基金
研究分野	社会医学、看護学およびその関連分野
研究機関	地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所
研究代表者	本村和嗣地方独立行政法人大阪健康安全基盤研究所, 微生物部, 課長 (60450558)
研究期間 (年度)	2017-06-30 – 2020-03-31
キーワード	ノロウイルス / 準種解析
研究成果の概要	自然環境（下水）および自然環境周辺に位置するヒト集団における集団食中毒事例について、ノロウイルスのゲノム解析情報を収集し、遺伝子型の分布状況や動態について解析した。初年度は、迅速かつ簡便な解析プログラムを作成し、2009年に発生したノロウイルスGII陽性食中毒事例の準種解析を行った。二年度は、ノロウイルスGI陽性食中毒事例を対象にし、GIもGII同様、個体内で複数の遺伝子型が混合感染していることがわかった。最終年度は、食中毒事例が発生した近くにある下水処理場から採取された下水試料の解析を行い、下水環境中の遺伝子型分布と一致し、ほぼ同時期にヒト集団内に存在していることがわかった。
自由記述の分野	感染症学
研究成果の学術的意義や社会的意義	自然環境（下水）の解析について関係当局と調整していたが協力を得られ、食中毒事例が発生した時期に採取され、場所が近い下水検体を用いて解析した。2009年11月から2011年5月までに採取された、GI 10検体、Group I I（GII） 15検体、計25検体について、MiSeq (illumina社)を用いて、網羅的に塩基配列を収集した。しかし、最終年度（昨年度）は、新型コロナウイルス感染症の検査対応のため、2009年12月、2010年1月、3月のGIの解析のみしか準種解析をできなかった。早急に、残りの検体の準種解析を実施し、自然環境、ヒト個体、ヒト集団内に存在する遺伝子型の動態を解析する。