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2019 年度 実施状況報告書

細菌型sRNAにおけるHfq結合領域の構造原理の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17KK0146
研究機関鈴鹿医療科学大学

研究代表者

森田 鉄兵  鈴鹿医療科学大学, 薬学部, 助教 (10444366)

研究期間 (年度) 2017 – 2020
キーワード小分子RNA / 転写後制御 / Hfq / 大腸菌 / 転写終結
研究実績の概要

Hfq結合型小分子RNA(sRNA)は、細菌で一般的な遺伝子発現の制御因子の1つである。本研究課題の目的は、sRNAがどのような機能構造を必要とするか、そして特に転写終結に焦点を当て、その機能構造の形成に必要な要素は何かを突き止めることである。本年度は、平成30年度にNIHでの共同研究により得られた成果をもとに、所属機関において研究を進めた。結果として、新規に同定した転写終結を阻害する因子が、モデルsRNAであるSgrSに加えて、他のsRNAの転写終結や生合成に影響を与えること、また一部のsRNAの機能を低下させることを確認した。これまで、sgrSの変異解析により、適切な位置での転写終結がsRNAの生合成に重要であるというモデルを示してきた。上記の結果は、このモデルを支持するものであり、また転写終結の制御因子によるsRNAの新規発現制御の可能性を示唆する。これらの結果は、Gorden Research Conference(米・ベイツ大学)や第93回 日本細菌学会総会(愛知)シンポジウムなどで発表した。
共同研究者であるSusan Gottesman博士(NIH)を日本に招聘し、京都大学(秋山 教授)との共催によりウイルス・再生医科学研究所セミナーを開催した。Gottesman博士と日本の細菌研究者との交流の場になり、活発な議論がなされた。Gottesman博士とは、スカイプや電子メールにより定期的にディスカッションを行っている。また、7月には1週間Gottesman博士の研究室に滞在し、今後の研究の進め方などを議論した。sRNA生合成と転写終結の研究について、背景や現状の課題を抽出した総説論文をFront. Cell. Infect. Microbiol.で発表した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

共同研究者であるGottesman博士を日本に招聘し、日本の細菌研究者との交流の場を提供したことは、本年度のもっとも意義のある成果である。総説論文の発表により、研究領域に問題提起したことも特筆すべき成果である。新規因子の機能解析も計画通りに進んでいることから、本研究課題はおおむね順調に進展している。

今後の研究の推進方策

新規因子が転写終結に及ぼす影響を明らかにするために、現在RNAseq解析を進めている。得られる結果をノーザンブロッティングにより確認し、転写終結制御の全容を解明する。4月にNIHのGisela Storz博士を招聘し、関連学会での招待講演、およびミニシンポジウムを行う予定だったが、渡航制限のため中止となった。Webを利用した交流の機会を考えている。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Regulation of Transcription Termination of Small RNAs and by Small RNAs: Molecular Mechanisms and Biological Functions2019

    • 著者名/発表者名
      Chen Jiandong、Morita Teppei、Gottesman Susan
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 9 ページ: 1-9

    • DOI

      doi: 10.3389/fcimb.2019.00201

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] The Role of transcription termination in sRNA biogenesis2020

    • 著者名/発表者名
      森田鉄兵
    • 学会等名
      第93回 日本細菌学会総会
    • 招待講演
  • [学会発表] Screening for factors affecting read-through at an sRNA rho independent terminator2019

    • 著者名/発表者名
      森田 鉄兵、Nadim Majdalani, Susan Gottesman
    • 学会等名
      第21回 RNA学会年会
  • [学会発表] Screening for factors affecting read-through at an sRNA rho independent terminator2019

    • 著者名/発表者名
      Teppei Morita, Nadim Majdalani, Susan Gottesman
    • 学会等名
      the Gorden Research Conference on Mechanisms of Microbial transcription
    • 国際学会

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公開日: 2021-01-27  

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