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2020 年度 実績報告書

消化器癌のバイオマーカー開発のためのmicrobiomeとエピジェネティクス解析

研究課題

研究課題/領域番号 17KK0195
研究機関熊本大学

研究代表者

馬場 祥史  熊本大学, 病院, 特任准教授 (20599708)

研究期間 (年度) 2018 – 2020
キーワードMicrobiome / Fusobacterium / 大腸癌 / 食道癌
研究実績の概要

消化器癌におけるMicrobiome(ヒト微生物叢)とエピジェネティック変化(LINE-1≒ゲノム全体のメチル化)の関連を網羅的に解析し、革新的なbiomarkerを開発することが現在実施中の科研費(基課題)の目的である。現在、私たちが構築した500例以上の食道癌データバンクを用いてFusobacteriumという候補microbiomeを同定しえたので、今後は このFusobacteriumが食道癌以外の消化器癌においても意義を有するのかを検討すること が必要である。今回の国際共同研究の目的は、ハーバード大学ダナ・ファーバー癌研究所 Molecular Pathological Epidemiology (MPE) Laboratoryの所有する大規模な前向き疫学コホートのサンプルを用いて、上記A, Bに関して検証することである。申請者は、2019年3月26日に渡米し、9月末までダナ・ファーバー癌研究所で共同研究を行った。ダナ・ファーバー癌研究所のコホートを用いて、大腸癌においてFusobacteriumとautophagyとの関係を示すことができ、共著者として J Pathol誌に発表した。また、大腸癌パラフィン包埋組織を用いたメタボローム解析についても従事し、その結果はMol Cancer Res誌に発表している。さらに、machine learningによる大腸癌組織中の免疫細胞の網羅的解析に関しても従事し、その結果はClin Cancer Res誌に掲載された。腫瘍免疫細胞の中でも腫瘍関連マクロファージの多重蛍光免疫染色による評価に関しても従事し、その研究成果はCancer Immunol Res誌に発表した。現在は、それら習得した研究解析手法を用いて食道癌を中心とした上部消化管癌における腫瘍免疫とLINE-1メチル化の関連解析を進めているところである。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2020 2019

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (2件)

  • [国際共同研究] Dana-Farber Cancer Institute(Harvard university)(アメリカ)2019

    • 年月日
      2019-03-26 – 2019-03-31 | 2019-04-012019-05-29 | 2019-06-032019-07-15 | 2019-07-212019-09-25
    • 国名
      アメリカ
    • 外国機関名
      Dana-Farber Cancer Institute(Harvard university)
    • 主な海外共同研究者名
      Professor. Shuji Ogino
    • 部局
      Department of medical oncology
    • 職名
      Professor
  • [雑誌論文] The Prognostic Role of Macrophage Polarization in the Colorectal Cancer Microenvironment2020

    • 著者名/発表者名
      Vayrynen JP, Baba Y, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Immunology Research

      巻: 9 ページ: 8~19

    • DOI

      10.1158/2326-6066.CIR-20-0527

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prognostic Significance of Immune Cell Populations Identified by Machine Learning in Colorectal Cancer Using Routine Hematoxylin and Eosin?Stained Sections2020

    • 著者名/発表者名
      Vayrynen JP, Baba Y, et al.
    • 雑誌名

      Clinical Cancer Research

      巻: 26 ページ: 4326~4338

    • DOI

      10.1158/1078-0432.CCR-20-0071

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metabolic Profiling of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissues Discriminates Normal Colon from Colorectal Cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Arima K, Baba Y, Ogino S et al.
    • 雑誌名

      Molecular Cancer Research

      巻: 18 ページ: 883~890

    • DOI

      10.1158/1541-7786.MCR-19-1091

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of autophagy status with amount of Fusobacterium nucleatum in colorectal cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Haruki K, Baba Y, Ogino S. et al
    • 雑誌名

      The Journal of Pathology

      巻: 250 ページ: 397~408

    • DOI

      10.1002/path.5381

    • 査読あり
  • [学会発表] バイオマーカー開発を目指した食道癌における腫瘍免疫及び免疫チェックポイントの網羅的検討2020

    • 著者名/発表者名
      馬場祥史
    • 学会等名
      第75回日本消化器外科学会総会
  • [学会発表] 食道癌における腫瘍免疫の網羅的解析;免疫関連バイオマーカー開発を目指して2020

    • 著者名/発表者名
      馬場祥史
    • 学会等名
      第120回日本外科学会定期学術集会

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公開日: 2021-12-27  

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