スーパー制限酵素による巨大DNA の遺伝子操作

2008 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 18001001
• 研究種目: 特別推進研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系; 化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 小宮山 眞 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (50133096)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: DNA / 制限酵素 / ペプチド核酸 / 遺伝子組換え / セリウム

研究概要

申請者らが開発してきた"スーパー制限酵素(Artificial Restriction DNA CUTter; ARCUT)"を完成させ、さらにこれを用いた遺伝子操作法を確立する。また、「巨大DNAを所望の位置で選択的に切断できる」というARCUTの特長を生かし、天然酵素を使用する従来法では実施困難な遺伝子操作を実現し、ニュー・バイオテクノロジーを創成する。

研究成果

• [雑誌論文] Human Telomeric DNA Sequence-Specific Cleaving by G-Quadruplex Formation (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Xu, Y. Suzuki, T. Lonnberg, M. Komiyama
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 131 ページ: 2871-2874
  • 査読あり
• [雑誌論文] Origin of High Fidelity in Target-Sequence Recognition by PNA Ce(IV)/EDTA Combinations as Site-Selective DNA Cutters (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Miyajima, T. Ishizuka, Y. Yamamoto, J. Sumaoka, M. Komiyama
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 131 ページ: 2657-2662
  • 査読あり
• [雑誌論文] Strand Invasion of Conventional PNA to Arbitrary Sequence in DNA Assisted by Single-Stranded DNA Binding Protein (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Ishizuka, K. Otani, J. Sumaoka, M. Komiyama
  • 雑誌名: Chem. Commun ページ: 1225-1227
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prompt Site-Selective DNA Hydrolysis by Ce(IV)-EDTA Using Oligonucleotide Multiphosphonate Conjugates (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Lonnberg, Y. Suzuki, M. Komiyama
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 6 ページ: 3580-3587
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-Selective Blocking of PCR by a Caged Nucleotide Leading to Direct Creation of Desired Sticky Ends in the Products (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Tanaka, H. Katada, N. Shigi, A. Kuzuya, M. Komiyama
  • 雑誌名: Chem Bio Chem 9 ページ: 2120-2126
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accommodation of a Single Protein Guest in Nanometer-Scale Wells Embedded in a "DNA Nanotape" (2008)
  • 著者名/発表者名: A. Kuzuya, K. Numajiri, M. Komiyama
  • 雑誌名: Angew. Chem., Int. Ed. 47 ページ: 3400-3402
  • 査読あり
• [雑誌論文] Artificial Restriction DNA Cutter for Site-Selective Scission of Double-Stranded DNA with Tunable Scission Site and Specificity (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Komiyama, Y. Aiba, Y. Yamamoto, J. Sumaoka
  • 雑誌名: Nat. Protoc. 3 ページ: 655-662
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solid-Phase Synthesis of Pseudo-Complementary Peptide Nucleic Acids (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Komiyama, Y. Aiba, T. Ishizuka, J. Sumaoka
  • 雑誌名: Nat. Protoc. 3 ページ: 646-654
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chiral Introduction of Positive Charges to PNA for Double-Duplex Invasion to Versatile Sequences (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Ishizuka, J. Yoshida, Y. Yamamoto, J. Sumaoka, T. Tedeschi, R. Corradini, S. Sforza, M. Komiyama
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 36 ページ: 1464-1471
  • 査読あり
• [学会発表] ジスルフィド結合を導入したPNAによるDNAの認識とその制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 愛場 雄一郎, 他
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 20090300
• [学会発表] 人工制限酵素を用いたヒト細胞内での遺伝子組換え (2009)
  • 著者名/発表者名: 堅田 仁, 他
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 20090300
• [学会発表] SSBおよび一本鎖PNAを用いた二本鎖DNAの配列特異的な認識 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石塚 匠, 他
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 20090300
• [学会発表] Ce(III)とリン酸系配位子修飾DNAによる位置特異的DNA切断 (2009)
  • 著者名/発表者名: 濱野 悠也, 他
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 20090300
• [学会発表] ポリメラーゼ反応の局所的阻害に適した新規ケージドヌクレオチドの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡田 文徳, 他
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 20090300
• [図書] 希土類の材料技術、5部第38章第1 節、「希土類イオンによるRNA、DNAの切断」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 葛谷明紀、小宮山眞
  • 出版者: エヌ・ティー・エス
• [図書] 超分子サイエンス、4章2節、「人工ヌクレアーゼ」
  • 著者名/発表者名: 堅田仁、宮島佳孝、小宮山眞
  • 出版者: エヌ・ティー・エス(印刷中)
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.mkomi.rcast.u-tokyo.ac.jp/index.html
• [産業財産権] 粘着末端を有するDNA断片の調製法 (2008)
  • 発明者名: 小宮山眞・葛谷明紀・田中啓太
  • 権利者名: 国立大学法人東京大学
  • 産業財産権番号: 特願2008-61678
  • 出願年月日: 2008-03-11
• [産業財産権] 標的核酸を位置選択的に切断する方法 (2007)
  • 発明者名: 小宮山眞・レンベルク トーマス・鈴木裕太
  • 権利者名: 国立大学法人東京大学
  • 産業財産権番号: 2007-299747
  • 出願年月日: 2007-11-19