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2006 年度 実績報告書

がんの個性の分子診断のための人工機能性核酸

研究課題

研究課題/領域番号 18014012
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

岡本 晃充  独立行政法人理化学研究所, 岡本独立主幹研究ユニット, 独立主幹研究員 (60314233)

キーワードがん / 一塩基多型 / 遺伝子解析 / ヌクレオシド / 蛍光
研究概要

本研究では、がん遺伝子をターゲットとした簡便変異解析システムを開発することはもちろんのこと、本提案の分子システムが遺伝子多型解析法を一変させるオプティカルデバイスとして作用する日本発の遺伝子解析技術を世界に提供することを目指した。その成果として、(1)本研究の基礎になる塩基識別型蛍光性核酸塩基のライブラリーの作成を強力に押し進め、その結果として、微視的環境によって蛍光が変化する新しい蛍光色素を導入した蛍光性塩基を作成した。これを核酸塩基に導入して新しい塩基識別型蛍光性核酸を得た。この蛍光色素を使うことによって、透過率などの面で検出装置の簡素化できるだけでなく、2波長検出系での遺伝子多型解析システムの開発が期待できる。(2)塩基識別型蛍光性核酸塩基を含む核酸プローブの設計を指針化した。がん関連遺伝子BRCA1での変異やフィラデルフィア染色体遺伝子BCR/ABLなどのタイピングを行うためのプローブを設計し、それらの蛍光応答を確認した。(3)オーダーメイド医療のために必要な塩基識別型蛍光性核酸のアレイを作成した。今回作成した核酸プローブは、溶液中で混ぜるだけで配列を判別できる。私は、核酸プローブをチップ上に固定化し、アレイの作成を試みた。担体上で標的核酸をハイブリダイゼーションさせたときに蛍光強度が減少したものの、蛍光発光は確認された。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] Methylation-Selective Fluorescence Quenching by Osmium Complexation2007

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, K.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. 15 (4)

      ページ: 1615-1621

  • [雑誌論文] DNA hole transport : application to effective photoelectrochemical SNP typing2006

    • 著者名/発表者名
      Okamoto, A.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 128 (2)

      ページ: 658-662

  • [雑誌論文] Electrochemical Evaluation of Alternating Duplex-Triplex Conversion Effect on the Anthraquinone-Photoinduced Hole Transport through DNA Duplex Immobilized on a Gold Electrode2006

    • 著者名/発表者名
      Tanabe, K.
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 128 (3)

      ページ: 692-693

  • [雑誌論文] Simple SNP typing assay using a base-discriminating fluorescent probe2006

    • 著者名/発表者名
      Okamoto, A.
    • 雑誌名

      Mol. BioSyst. 2 (2)

      ページ: 122-127

  • [雑誌論文] Sequence-selective osmium oxidation of DNA : Efficient distinction between 5-methylcytosine and cytosine2006

    • 著者名/発表者名
      Okamoto, A.
    • 雑誌名

      Org. Biomol. Chem. 4 (9)

      ページ: 1638-1640

  • [雑誌論文] Nile Red nucleoside : Design of a solvatofluorochromic nucleoside as an indicator of micropolarity around DNA2006

    • 著者名/発表者名
      Okamoto, A.
    • 雑誌名

      J. Org. Chem. 71 (9)

      ページ: 3592-3598

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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