細胞間相互作用のシステム的理解

2008 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 18016031
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 上田 泰己 独立行政法人理化学研究所, システムバイオロジー研究チーム, チームリーダー (20373277)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: 体内時計 / 細胞間相互作用 / 再構成 / 転写制御 / 位相 / 哺乳類

研究概要

動的で複雑な生命現象を理解することは一般的に難しく、その解明のための手法・研究戦略は発展途上の段階である。特に多細胞生物を多細胞生物たらしめている細胞間相互作用を担う動的で複雑なシステムを体系的・効率的に同定・解析していく手法・研究戦略については、まだ確立されているとは言えない。我々は、動的で複雑な細胞間相互作用の一つである哺乳類の概日時計における細胞間相互作用をモデル系とし、インシリコ・インビボにおいて細胞間相互作用の遺伝子ネットワークを設計・再構成することで、予測されうるメカニズムの再構成的証明を行う。これらの解析を通して細胞間相互作用の設計原理を理解するとともに、細胞分化など細胞間相互作用を要とする他の生命現象にも応用可能な研究戦略を提供する。

研究成果

• [雑誌論文] Proof-by-Synthesis of the Transcriptional Logic of Mammalian Circadian Clocks (2008)
  • 著者名/発表者名: Ukai-Tadenuma, M., Kasukawa, T. and Ueda, H.R
  • 雑誌名: Nature Cell Biology 10 ページ: 1154-1163
  • 査読あり
• [雑誌論文] Melanopsin-dependent photo-perturbation reveals desynchronization underlying the singularity of mammalian circadian clocks (2007)
  • 著者名/発表者名: Ukai, H., Kobayashi, T.J., Nagano, M., Masumoto, K., Sujino, M., Kondo, T., Yagita K., Shigeyoshi, Y. and Ueda, H.R.
  • 雑誌名: Nature Cell Biology 9 ページ: 1327-1334
  • 査読あり
• [雑誌論文] Feedback repression is required for mammalian circadian clock function (2006)
  • 著者名/発表者名: Sato, T.K., Yamada, R.G., Ukai, H., Baggs, J.E., Miraglia, L.J., Kobayashi, T.J., Welsh, D.K., Kay, S.A., Ueda, H.R. and Hogenesch, J.B
  • 雑誌名: Nature Genetics 38 ページ: 312-319
  • 査読あり
• [学会発表] 哺乳類体内時計の制御と設計 (2007)
  • 著者名/発表者名: 上田泰己
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会(BMB2007)
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20071200
• [学会発表] Analysis and synthesis of circadian clocks (2006)
  • 著者名/発表者名: 上田泰己
  • 学会等名: 第13回日本時間生物学会学術大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20061200
• [学会発表] 細胞集団の振る舞いとして理解する概日時計 (2006)
  • 著者名/発表者名: 上田泰己
  • 学会等名: 第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会 合同大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20060500
• [図書] 体内時計のシンギュラリティ現象の解明(Vol.14, No.1) (2008)
  • 著者名/発表者名: 上田泰己
  • 総ページ数: 2-8(6)