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2007 年度 実績報告書

植物に特徴的な倍数性ゲノム間相互作用に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 18017021
研究機関福井県立大学

研究代表者

村井 耕二  福井県立大学, 生物資源学部, 教授 (70261097)

研究分担者 荻原 保成  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 教授 (40185533)
キーワード倍数性 / 同祖遺伝子 / 発現調節 / 環境応答 / ゲノム間相互作用 / 倍数性進化 / 花成制御 / 貯蔵タンパク質
研究概要

異質倍数体であるパンコムギの3種ゲノム上の遺伝子がどのように発現が制御されているのかを比較ゲノム科学的方法で解析することを目的とし,以下の研究を行った。(1)コムギの生活環の種々の組織,ストレス処理をした組織,都合46組織、処理からcDNAライブラリーを構築し,各クローンのEST解析を行った。合計約63万シークエンスをグルーピングし,約3万5千の遺伝子クラスターをえた。これは全遺伝子の90%以上と見積もっている。これらの遺伝子の各組織・処理での発現パターンを特徴つけた。(2)花器官形成過程にはたらく遺伝子を詳細に解析した。モデル植物に対応する遺伝子の発現パターンを明らかにすることができた。それぞれ,ジェネティック、エピジェネティックの制御システムがはたらいていることが明らかになった。(3)比較的発現量の多い遺伝子について,6倍体のパンコムギの3種ゲノムのうち,どのゲノムから発現されているかを解析し,座乗染色体を明らかにした。(4)多重遺伝子族であるパンコムギの貯蔵タンパク質遺伝子の構造と発現様式を解析した。(5)塩に応答する遺伝子をDNAマイクロアレイを用いて網羅的に解析し,発現遺伝子を特徴つけた。コムギESTはNCBIの発現遺伝子登録サイトで全生物種で第10位,植物種で第5位である。そのうち,約60%をこのプロジェクトで貢献している。このプロジェクトでは,パンコムギの標準品種であるChinese Springの単一品種を基本的に用いており,それぞれの組織で発現する遺伝子のボディマップを作成している。これらの貢献は,コムギの機能ゲノム科学に重要な貢献をしており,世界的に高く評価されている。

  • 研究成果

    (19件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (13件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Structures of the three homoeologous loci of wheat benzoxazinone biosy nthetic genes TaBx3 and TaBx4 and characterization of their promoter sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Nomura, et. al.
    • 雑誌名

      Theor.Appl.Genet 116

      ページ: 373-381

  • [雑誌論文] Genetic and epigenetic alteration among three homoeologous genes of a class E MADS box gene in hexaploid wheat2007

    • 著者名/発表者名
      Shitsukawa, et. al.
    • 雑誌名

      The Plant Cell 19

      ページ: 1723-1737

    • 査読あり
  • [学会発表] パンコムギWAP2伝子の機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      川浦 香奈子, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第113回講演会
    • 発表場所
      川崎
    • 年月日
      2008-03-29
  • [学会発表] SDS-PAGEによるパンコムギ種子貯蔵タンパク質グリアジンの識別とRNAi形質転換体の作出2008

    • 著者名/発表者名
      齋藤 美沙, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第113回講演会
    • 発表場所
      川崎
    • 年月日
      2008-03-29
  • [学会発表] NMR代謝プロファイリングによる穀物形質評価(3)メタボロフェノタイプとジェノタイプ情報の比較解析2008

    • 著者名/発表者名
      持田 恵一, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第113回講演会
    • 発表場所
      川崎
    • 年月日
      2008-03-29
  • [学会発表] 植物ゲノム情報から推定したトランスポーターの網羅的な比較解析2008

    • 著者名/発表者名
      持田 恵一, ら
    • 学会等名
      第49回植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2008-03-21
  • [学会発表] Comprehensive analysis of expressed sequence tags in common wheat2007

    • 著者名/発表者名
      Ogihara, et. al.
    • 学会等名
      The Aaronsohn-ITMI International Conference
    • 発表場所
      Tiberias,Israel
    • 年月日
      20070416-20
  • [学会発表] 倍数性コムギのMADSボックス遺伝子にみられる同祖遺伝子間での異なる発現制御機構2007

    • 著者名/発表者名
      漆川 直希, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第112回講演会
    • 発表場所
      鶴岡
    • 年月日
      2007-09-23
  • [学会発表] パンコムギにおけるAP2様遺伝子の発現機構の解析2007

    • 著者名/発表者名
      川浦 香奈子, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第112回講演会
    • 発表場所
      鶴岡
    • 年月日
      2007-09-23
  • [学会発表] NMR代謝プロファイリングによる穀物形質評価(2)主要代謝産物バランスの比較2007

    • 著者名/発表者名
      持田 恵一, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第112回講演会
    • 発表場所
      鶴岡
    • 年月日
      2007-09-23
  • [学会発表] 倍数性コムギのMADSボックス遺伝子にみられる同祖遺伝子間のジェネティックおよびエピジェネティック変異2007

    • 著者名/発表者名
      村井耕二, ら
    • 学会等名
      日本遺伝学会弟79回大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2007-09-21
  • [学会発表] 小麦ゲノム情報が世界の食料危機を救う」-適作情報の発信拠点をめざす木原生物学研究所2007

    • 著者名/発表者名
      荻原保成
    • 学会等名
      東京テクノフォーラム21第104回研究交流会
    • 発表場所
      日本プレスセンター
    • 年月日
      2007-09-12
  • [学会発表] Full length cDNA collection of Chinese Spring wheat as an aid to annotate the wheat genome2007

    • 著者名/発表者名
      Ogihara, et. al.
    • 学会等名
      Triticeae Genomics-Current status and utility of the chromosome based strategies
    • 発表場所
      Olomouc,Czech Republic
    • 年月日
      2007-04-23
  • [学会発表] コムギクラスE MADS-box遺伝子における同祖遺伝子間での構造変異と発現制御機構の分化2007

    • 著者名/発表者名
      漆川 直希, ら
    • 学会等名
      日本育種学会第111回講演会
    • 発表場所
      茨城大学
    • 年月日
      2007-03-30
  • [学会発表] 倍数性コムギのクラスE MADSボックス遺伝しにみられる同祖遺伝子間のジェネティックおよびエピジェネティック変異2007

    • 著者名/発表者名
      村井 耕二, ら
    • 学会等名
      特定ゲノム4領域 領域横断植物研究会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2007-03-17
  • [図書] 倍数性とエピジェネティックス(植物のエピジェネティックス)2008

    • 著者名/発表者名
      村井 耕二
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      秀潤社
  • [図書] コムギMADS遺伝子のエピジェネティックス(植物のエピジェネティックス)2008

    • 著者名/発表者名
      漆川 直希、村井 耕二
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      秀潤社
  • [図書] コムギの比較ゲノム解析.比較ゲノムによる進化研究の最前線日本の遺伝学の潮流2007

    • 著者名/発表者名
      荻原 保成
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      エヌ・ティ・エス
  • [図書] 倍数性コムギの比較ゲノム.比較ゲノムから読み解く生命システム.2007

    • 著者名/発表者名
      荻原 保成
    • 総ページ数
      7
    • 出版者
      秀潤社

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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