シングルセル発現プロファイル解析の実践と技術開発

2006 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 18018023
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 杉本 幸彦 京都大学, 薬学研究科, 助教授 (80243038)
• キーワード: シングルセル / マイクロアレイ / 発現プロファイル / マスト細胞 / 肝癌 / 動脈管 / プロスタグランジン / シクロオキシゲナーゼ

研究概要

本研究の目的は、細胞単位で回収した細胞をプールして、その細胞集団に特異的な発現プロファイルを捉え、その生物学的意義を理解するとともに、このような解析技術を実用的に改良・開発することである。以下に本年度の成果を示す。
1)組織マスト細胞の解析
消化管胃部切片より粘膜層ならびに粘膜下層に存在するMMCとCTMCを各15細胞プールし、発現プロファイルを比較した。
MMC/CTMCに偏った発現を示す各4遺伝子についてReal-time PCR解析を行ったところ、いずれもアレイ解析を再現した。このような3回の独立試行の結果、CTMC特異遺伝子、MMC特異発現発現遺伝子群を同定した。
2)化学物質による肝癌初期巣
発がんイニシエーター誘発性肝癌モデルで、肝癌マーカーである胎盤型グルタチオンS-転移酵素(GSTP)発現を指標に、肝癌の初期病巣(foci)と正常肝細胞との発現プロファイルを比較し、癌毒性で早期に変化する遺伝子群を同定した。その結果、GSTP陽性細胞で発現増加する遺伝子が非常に多く見られた。なかでも、代謝に関与する遺伝子群1,500の10%が発現亢進していた。
3)プロスタグランジンEP4受容体欠損と動脈管開存
研究代表者は、PGE2-EP4-cAMPシグナルが、動脈管平滑筋のヒアルロン酸分泌の促進と細胞遊走の亢進、さらには内膜形成の促進により、動脈管が閉鎖することを示した。

研究成果

• [雑誌論文] Oxytocin-induced phasic and tonic contractions are modulated by the contractile machinery rather than the quantity of oxytocin receptor. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kawamata, M., Tonomura, Y., Kimura, T., Sugimoto, Y., Yanagisawa, T., Nishimori, K.
  • 雑誌名: Am.J.Physiol.Endocrinol.Metab. (印刷中)
• [雑誌論文] Prostaglandin E receptors. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, Y., Narumiya, S.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 282(印刷中)
• [雑誌論文] Chronic activation of the prostaglandin receptor EP4 promotes hyaluronan-mediated neointimal formation in the ductus arteriosus. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, U., Ninamisawa, S., Hong.Q., Chatak.S., Akaike.T., Segi-Nishida, E., Iwasaki, S., Iwamoto, M., Nisra, S., Tamura, K., Hori, H., Yokota, S., Toole, B.P., Sugimoto, Y., Ishikawa, Y.
  • 雑誌名: J.Clin.Invest. 116 ページ: 3026-3034
• [雑誌論文] Attenuated cyclooxygenase-2 expression contributes to patent ductus arteriosus in preterm mice. (2006)
  • 著者名/発表者名: Trivedi, D.B., Sugimoto, Y., Loftin, C.D.
  • 雑誌名: Pediatr.Res. 60 ページ: 669-674
• [雑誌論文] Reduction of aquaporin-8 on fetal membranes under oligohydramnios in mice lacking prostaglandin F2 alpha receptor. (2006)
  • 著者名/発表者名: Shioji, M., Fukuda, H., Kanzaki, T., Wasada, K., Kanagawa, T., Shimoya, K., Mu, J., Sugimoto, Y., Murata.Y.
  • 雑誌名: J.Obstet.Gynaecol.Res. 32 ページ: 373-378