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2007 年度 実績報告書

蛋白質のスローフォールディングにおける水の役割

研究課題

研究課題/領域番号 18031013
研究機関富山大学

研究代表者

水口 峰之  富山大学, 大学院・医学薬学研究部, 准教授 (30332662)

キーワードタンパク質 / フォールディング / 中間体 / NMR / キメラタンパク質
研究概要

超好熱菌PCPと中温菌PCPのキメラタンパク質を作製し安定性やアンフォールディング速度について調べた。超好熱菌PCPと中温菌PCPの立体構造を比較すると、超好熱菌PCPのC末端領域にはαヘリックスが2本(α5とα6)あるが、中温菌PCPではヘリックスの一部がループ構造になっている。そこで、超好熱菌PCPの異常に遅いアンフォールディングはC末端構造の違いによると予想し、数種類のキメラタンパク質を作製し実験を行った。超好熱菌PCPの174-208残基を中温菌PCPにしたキメラでは大きく不安定化したが、174-183残基だけを中温菌PCPに変えたキメラでは不安定化の程度はかなり小さかった。また、174-208残基を中温菌PCPにしたキメラではアンフォールディング速度が著しく増加した。したがって、超好熱菌PCPの高い熱安定性と異常に遅いアンフォールディングはC末端に位置する174-208残基の構造によることが明らかになった。
また、超好熱菌PCPのC末端半分に相当する113-208残基のフラグメントPCP(113-208)を作製し、NMRによってその特徴を調べた。その結果、PCP(113-208)はマイクロ〜ミリ秒で運動しておりコンフォメーション交換の状態にあることがわかった。次に、さまざまな濃度の尿素存在下でPCP(113-208)の^1H-^<15>N HSQCを測定し変性過程について調べた。スペクトル上で分離していた複数のピークについて強度と^<15>Nケミカルシフトをプロットしたところ、PCP(113-208)の尿素変性は非協同的で徐々に起こることが示された。以上の結果から、超好熱菌PCPのフォールディングでは、フォールディング初期にC末端半分だけがモルテングロビュール様の構造をもつ中間体(D1状態)となり、その中間体は非協同的な相互作用によって安定化されていることがわかった。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2007

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Role of C-terminal α-helix of pyrrohdone carboxyl peptidase from a hyperthermophile in folding and stability.2007

    • 著者名/発表者名
      Iimura, S., et. al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 46

      ページ: 3664-3672

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ER quality control regulates the fate of transthyretin variants in the cell.2007

    • 著者名/発表者名
      Sato, T., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO Journal 26

      ページ: 2501-2512

    • 査読あり
  • [学会発表] 全長pyrrolidone carboxyl peptidaseの中間体構造とC末端フラグメントの立体構造2007

    • 著者名/発表者名
      竹内誠, 水口峰之, 油谷克英, 森佳洋, 篠田裕之, 河野敬一.
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台市)
    • 年月日
      2007-05-26
  • [学会発表] 超好熱菌由来pyrrolidone carboxyl peptidaseの野生型と変異体A199Pの立体構造と変性機構の比較2007

    • 著者名/発表者名
      飯村哲史, 梅嵜太郎, 坂本恵子, 岡崎伸生, 竹内誠, 水口峰之, 小笠原京子, 野田康夫, 瀬川新一, 油谷克英.
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台市)
    • 年月日
      2007-05-26

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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