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2007 年度 実績報告書

人工設計ペプチドを用いたへリックス構造モチーフの設計原理に関する高圧分光研究

研究課題

研究課題/領域番号 18031039
研究機関立命館大学

研究代表者

加藤 稔  立命館大学, 理工学部, 教授 (00241258)

キーワード人工設計ペプチド / 赤外分光法 / 圧力効果 / ヘリックスーコイル転移 / ヘリックス
研究概要

1.Ala残基を多く含むAK型ペプチドは、加圧よりヘリックス構造が増加する。この原因として、Ala残基のCO基が溶媒である水との水素結合にあると考えられている。AKペプチドのアミドIバンドの低波数シフトもこの水和が原因と考えられている。水和と波数シフトとの関係を明らかにするために、N-methylacetamide2量体-水系のDFT計算(B3LYP/6-31G++(d,p)レベル)を行った。アミドIモードは1652cm^<-1>と1700cm^<-1>に強い赤外活性を与えた。前者は水素結合により大きく低波数シフトし、水素結合距離を短くする(加圧することに相当)とより低波数シフトを示した。これらの結果は高圧赤外実験と一致した。
2.AK型ペプチドとコイルドコイル構造をもつGCN4-Plは、加圧に伴いヘリックス構造が安定化する。ペプチドとタンパク質での圧力挙動の違いを明らかにするために、α/β型のペプチドである・Croをモデル系とした。2次構造変化の追跡には赤外アミドIモードを用いた。天然配列、デノボ配列・Croはともに高圧下でunfoldしたが、興味深い違いも示した。βシートのunfold圧力はデノボ配列で約250MPa、天然配列で約330MPaであったが、ヘリックスの変性圧力はデノボで約670MPa、天然配列で約390MPaとなった。デノボではヘリックスの圧力安定性が著しく増した。
3.シニョリンは人工配列ではあるが、熱変性において協同的変性を示すことが確認されているβヘアピンペプチドである。ヘリックスの場合との比較を目的に、高圧下の赤外分光実験を行った。アミドI赤外スペクトルは、典型的なβ構造の特徴を示し、加圧に伴いβのピークは減少した。ピーク強度の圧力依存性から、変性圧力は約200MPa、変性に伴う体積変化は-21cm^3/molと見積もられた。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Pressure effect on the amide I frequency of the solvated α-helical structure in water.2007

    • 著者名/発表者名
      T. Takekiyo, Y. Yoshimura, A. Shimizu, T. koizumi, M Kato, Y. Taniguchi
    • 雑誌名

      J. Phys.: Condens. Matter 19

      ページ: 425212

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pressure stability of the ・-helix structure in de Novo designed Protein (・-1-・)_2 studied by FT-IR spectroscopy2007

    • 著者名/発表者名
      T. Takekiyo, N. Takeda, Y. Isogai, M. Kato, Y. Taniguchi
    • 雑誌名

      Biopolymers 85

      ページ: 185-188

  • [雑誌論文] Pressure-induced helix-coil transition of poly-L-glutamic acid in water

    • 著者名/発表者名
      T. Takekiyo, Y. Yoshimura, A. Shimizu, T. Koizumi, M Kato, Y Taniguchi
    • 雑誌名

      J. Phys. Conf. Ser., (印刷中)

    • 査読あり
  • [学会発表] Effect of pressure on the secondary structure of ・-helical and ・-hairpin peptides2008

    • 著者名/発表者名
      H. Imamura, Y. Isogai, and M. Kato,
    • 学会等名
      The 5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      20080124-25
  • [学会発表] Pressure-temperature stability and the thermodynamic aspects of ・-lactalbumin2008

    • 著者名/発表者名
      T. Yamamoto and M. Kato
    • 学会等名
      The 5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      20080124-25
  • [学会発表] Effect of pressure on the conformational equilibrium and kinetics of poly-(L-lysine)2008

    • 著者名/発表者名
      T. Tomoda, H. Imamura and M. Kato
    • 学会等名
      The 5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      20080124-25
  • [学会発表] FT-IR法によるαヘリカルペプチドおよびβヘアピンペプチドの二次構造におよぼす圧力効果の研究2007

    • 著者名/発表者名
      今村比呂志、加藤 稔
    • 学会等名
      第48回高圧討論会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      20071100
  • [学会発表] 高圧FT-IR法によるβ一hairpin構造の安定性の研究2007

    • 著者名/発表者名
      今村比呂志, 加藤 稔
    • 学会等名
      第7回蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20070500

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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