生体系の柔軟な構造と反応過程の理論的研究

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18066013
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 吉澤 一成 九州大学, 先導物質化学研究所, 教授 (30273486)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: 量子化学 / 酵素反応 / 物性化学

研究概要

本研究では、量子力学/分子力学計算および分子動力学シミュレーションにより酵素の活性構造と反応機構についての数万原子規模の計算を行う。この方法により酵素反応におけるキーポイントである基質特異性あるいは立体特異的反応の作用機構について研究する。

研究成果

• [雑誌論文] Theoretical Analysis of Diradical Nature of Adenosylcobalamin Cofactor-Tyrosine Complex in B12-Dependent Mutases: Inspiring PCET Driven Enzymatic Catalysis (2010)
  • 著者名/発表者名: P.M. Kozlowski, T. Kamachi, M. Kumar, T. Nakayama, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Physical Chemistry B 411(inpress)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Theoretical Study of Thermal Spin Transition between the Singlet State and the Quintet State in the [Fe(2-pic)3]2+ Spin Crossover System (2-pic: 2-picolylamine) (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Shiota, D. Sato, G. Juhasz, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry A 114(in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of the Reactivity of Bis(μ-oxo)CuIICuIII and CuIIICuIII Species to Methane (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Shiota, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 48 ページ: 838-845
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photochemical Reversibility of Ring-Closing and Ring-Opening Reactions in Diarylperfluorocyclopentenes (2009)
  • 著者名/発表者名: A. Staykov, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry C 113 ページ: 3826-3834
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bistability of Magnetization without Spin-Transition in a High-Spin Cobalt(II) Complex due to Angular Momentum Quenching (2009)
  • 著者名/発表者名: G. Juhasz, R. Matsuda, S. Kanegawa, K. Inoue, O. Sato, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 131 ページ: 4560-4561
  • 査読あり
• [雑誌論文] DFT Study on N2 Activation by a Hydride-Bridged Diniobium Complex. N≡N Bond Cleavage Accompanied by H2 Evolution (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Tanaka, Y. Shiota, T. Matsuo, H. Kawaguchi, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 48 ページ: 3875-3881
  • 査読あり
• [雑誌論文] What is the Identity of the Metal Ions in the Active Sites of Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase? A Computational Mutation Analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Kamachi, M. Takahata, T. Toraya, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 113(Cover Article) ページ: 8435-8438
  • 査読あり
• [雑誌論文] Catalytic Mechanism of Fluoroacetate Dehalogenase: Computational Exploration of the Biological Dehalogenation (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Kamachi, T. Nakayama, O. Shitamichi, K. Jitsumori, T. Kurihara, N. Esaki, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Chemistry-A European Journal 15 ページ: 7394-7403
  • 査読あり
• [雑誌論文] Thin Solid Films (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Tsuji, A. Staykov, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Orbital View Concept Applied on Photoswitching Systems 518 ページ: 264-267
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metal-Ligand Cooperation in H2 Production and H2O Decomposition on a Ru(II) PNN Complex: the Role of Ligand Dearomatization-Aromatization (2009)
  • 著者名/発表者名: J. Li, Y. Shiota, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 131 ページ: 13584-13585
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stereochemistry of Disilanylene-Containing Cyclic Compounds. Synthesis and Palladium-Catalyzed Reactions of cisand trans-3, 4-Benzo-1, 2-diisopropyl-1, 2-di methyl-1, 2-disilacyclobut-3-ene (2009)
  • 著者名/発表者名: A. Naka, J. Sakata, J. Ikadai, H. Kawasaki, J. Ohshita, A. Kunai, K. Yoshizawa, M. Ishikawa
  • 雑誌名: Zeitschrift fur Naturforschung B 64 ページ: 1580-1590
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nickel(II), Palladium(II), and Platinum(II)η3-Allyl Complexes Bearing a Bidentate Titanium(IV) Phosphinoamide Ligand: A Ti-M2 Dative Bond Enhances the Electrophilicity of theπ-Allyl Moiety (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Tsutsumi, Y. Sunada, Y. Shiota, K. Yoshizawa, H. Nagashima
  • 雑誌名: Organometallics 28 ページ: 1988-1991
  • 査読あり
• [雑誌論文] Silicon-Carbon Unsaturated Compounds. 76. Photochemical and Thermal Behavior of 1-Silacyclobut-3-enes Generated from the Reaction of Pivaloyltris(trimethylsilyl)silane with tert-Butylacetylene (2009)
  • 著者名/発表者名: A. Naka, N. Senba, S. Motoike, H. Fujimoto, T. Miura, H. Kobayashi, K. Yoshizawa, M. Ishikawa
  • 雑誌名: Organometallics 28 ページ: 5641-5646
  • 査読あり
• [雑誌論文] Orbital Control of the Conductance Photoswitching in Diarylethene (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Tsuji, A. Staykov, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry C 113 ページ: 21477-21483
  • 査読あり
• [雑誌論文] heoretical Study on Activation and Protonation of Dinitrogen on Cubane-Type MIr3S4 Clusters (M = V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Mo, Ru and W) (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Tanaka, F. Ohsako, H. Seino, Y. Mizobe, K. Yoshizawa
  • 雑誌名: Inorganic Chemistry 49 ページ: 2464-2470
  • 査読あり
• [学会発表] Computational Mutation of the Structure and Reactivity of B12-Dependent Diol Dehydratase (2009)
  • 著者名/発表者名: Kazunari Yoshizawa
  • 学会等名: Gordon Research Conference on 'Vitamin B12 and Corphins'
  • 発表場所: Oxford University (Magdalen College)
  • 年月日: 20090902-20090807
• [図書] 物理化学基礎の基礎 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉澤一成, 他
  • 総ページ数: 294
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 化学のブレークスルー【理論化学編】 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉澤一成, 他
  • 総ページ数: 113
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 狭い空間で働く概念 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉澤一成, 他
  • 出版者: 化学同人
• [備考]
  • URL: http://10.100.0.24/yoshizawaJ/index.html