個別化医療の実現に向けた情報統計力学的理論構築及び手法開発

2008 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 18079012
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系
• 研究機関: 早稲田大学
• 研究代表者: 井上 真郷 早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (70376953)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: 情報統計力学 / 確率的情報処理 / 個別化医療

研究概要

個別化医療(オーダーメイド医療)を実現するための情報統計力学的理論構築,手法開発を行う.特に,患者の一塩基多型(SNP)データからhaplotype推定し,集団でのhaplotype頻度を構造解析・クラスタリングし,治療効果との関連付けを行い,最終結果を採取すべきSNP座位へとフィードバックする理論・手法を構築開発し,患者一人ひとりに応じた診療を行うことを技術的に可能とする道筋をつける.何れの情報処理ステップも,データが高次元であるために従来の枠組みでは上手く扱えておらず,情報統計力学的手法がブレークスルーになると期待される.

研究成果

• [雑誌論文] 2体結合モデルによる統計力学的ハプロタイプ推定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 千明裕, 進藤裕, 井上真郷
  • 雑誌名: 電子情報通信学会技術研究報告 108(480) ページ: 405-410
• [雑誌論文] Grouping preprocess to accurately extend application of EM algorithm to haplotype inference (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Shindo, Hiroshi Chigira, Junji Tanaka, Naoyuki Kamatani, Masato Inoue
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 53(8) ページ: 747-756
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bayesian-Optimal Image Reconstruction for Translational-Symmetric Filters (2008)
  • 著者名/発表者名: Satohiro Tajima, Masato Inoue, Masato Okada
  • 雑誌名: Journal of the Physical Society of Japan 77(5) ページ: 054803
  • 査読あり
• [雑誌論文] LDPC decoding dynamics from a PCA viewpoint (2007)
  • 著者名/発表者名: Shinpei Hara, Yuta Akira, Eisuke Ishii, Masato Inoue, Masato Okada
  • 雑誌名: Interdisciplinary Information Sciences 13(1) ページ: 43-48
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis method combining Monte Carlo simulation and principal component analysis -- application to Sourlas code (2006)
  • 著者名/発表者名: Masato Inoue, Koji Hukushima, Masato Okada
  • 雑誌名: Journal of the Physical Society of Japan 75(8) ページ: 084003
  • 査読あり
• [学会発表] 2体結合モデルによる統計力学的ハプロタイプ推定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 千明裕, 進藤裕之, 井上真郷
  • 学会等名: 電子情報通信学会ニューロコンピューティング研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20090300
• [学会発表] 適応的自然勾配法の特異モデル学習への適用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 西村佳也, 井上真郷
  • 学会等名: 電子情報通信学会ニューロコンピューティング研究会
  • 発表場所: 沖縄
  • 年月日: 20080600
• [学会発表] Bowman-Levin法を用いたLDPC復号 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田村健一, 小宮美穂, 井上真郷, 樺島 祥介
  • 学会等名: 第11回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2008)
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2008-10-29
• [学会発表] haplotype推定における指数関数的計算量を削減するためのグルーピング前処理 (2007)
  • 著者名/発表者名: 進藤裕之, 千明裕, 田中順治, 鎌谷直之, 井上真郷
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第52回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-09-14
• [学会発表] 畳み込みフィルタ出力を考慮した画像修復 (2007)
  • 著者名/発表者名: 橋口友美, 井上真郷, 岡田真人
  • 学会等名: 日本物理学会2007年春季大会
  • 発表場所: 鹿児島
  • 年月日: 2007-03-20
• [備考] ソフトウエア公開 HaploBorder (SNP データよりhaplotype を推定するソフトウエア)
  • URL: http://www.eb.waseda.ac.jp/m_inoue/downloads/