細胞複雑系での適用をめざしたタンパク質有機化学の新手法開発

2008 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 18205020
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 浜地 格 京都大学, 大学院・工学研究科, 教授 (90202259)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: 細胞系 / 有機化学 / タンパク質 / ラベル化反応 / 分子認識

研究概要

本研究の全体構想は、生体高分子の代表であるタンパク質表面を任意にかつ特異的に認識し、それをデザインしたとおりに価額返還できる有機化学の創製およびそれを基盤的な方法論とした細胞という複雑混合系での有機化学・生命化学の新しい研究領域を開拓することである。
具体的には、認識素子となる人工レセプタ-の開発、水中穏和な条件で進行する有機反応の探索、それらを組み合わせたタンパク質構造変換反応の創製、さらにそのような有機反応を基盤としたタンパク質の人工機能化、試験管内だけでなく究極の夾雑系の一つである細胞系での精密有機化学を展望した細胞、生態系でも使える化学的手法の創製などからなる。

研究成果

• [雑誌論文] Ligand-directed tosyl chemistry for protein labeling in vivo (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Tsukiji, M. Miyagawa, Y. Takaoka, T. Tamura, I. Hamachi
  • 雑誌名: Nature Chemical Biology 5 ページ: 341-343
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Recognition, Fluorescence Sensing, and Biological Assay of Phosphate Anion Derivatives Using Artificial Zn(II)-Dpa Complexes (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Sakamoto, A. Ojida, I. Hamachi
  • 雑誌名: Chem. Commun., Feature Article ページ: 141-152
• [雑誌論文] Target-Specific Chemical Acylation of Lectins by Ligand-Tethered DMAP Catalysts (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Koshi, E. Nakata, M. Miyagawa, S. Tsukiji, T. Ogawa, I. Hamachi
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 130 ページ: 245-251
• [雑誌論文] Affinity Labeling-Based Introduction of a Reactive Handle for Natural Protein Modification (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Wakabayashi, M. Miyagawa, Y. Koshi, Y. Takaoka, S. Tsukiji, I. Hamachi
  • 雑誌名: Chem. -An Asian J 3 ページ: 1134-1139
• [雑誌論文] Non-enzymatic Covalent Protein Labeling Using a Reactive Tag (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Nonaka, S. Tsukiji, A. Ojida, I. Hamachi
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 129 ページ: 15777-15779
• [雑誌論文] Oligo-Asp Tag/Zn(II)-Complex Probe as a New Pair for Labeling and Fluorescence Imaging of Protein (2006)
  • 著者名/発表者名: A. Ojida, K. Honda, D. Shinmi, S. Kiyonaka, Y. Mori, I. Hamachi
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 128 ページ: 10452-10459
• [雑誌論文] One-pot and Sequential Organic Chemistry on an Enzyme Surface to Tether a Fluorescent Probe at the Proximity of the Active Site with Restoring Enzyme Activity (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Takaoka, H. Tsutsumi, N. Kasagi, E.Nakata, I. Hamachi
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 128 ページ: 3273-3280
• [雑誌論文] Effective Disruption of Phosphoprotein-Protein Surface Interaction Using Zn (II) Dipicolylamine-Based Artificial Receptors via Two-Point Interaction (2006)
  • 著者名/発表者名: A. Ojida, M. Inoue, Y. Mito-oka, H. Tsutsumi, K. Sada, I. Hamachi
  • 雑誌名: J. Am, Chem. Soc 128 ページ: 2052-2058
• [学会発表] New Chemical Methods for Protein Labeling (2008)
  • 著者名/発表者名: I. Hamachi
  • 学会等名: 2008 RIKEN Conference on Chemical Biology
  • 発表場所: Narita, Japan
  • 年月日: 20081112-15
• [学会発表] Chemistry-based Protein Labeling (2008)
  • 著者名/発表者名: I. Hamachi
  • 学会等名: 22th Naito Conference
  • 発表場所: Sapporo, Japan
  • 年月日: 20080908-12
• [学会発表] New Chemical Methods for Selective Protein Labeling (2008)
  • 著者名/発表者名: I. Hamachi
  • 学会等名: BMB2008
  • 発表場所: Kobe, Japan
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] タンパク質選択的ケミカルラベリングの新手法 ; レクチンを中心に (2008)
  • 著者名/発表者名: 浜地 格
  • 学会等名: 糖質科学フォーラム
  • 発表場所: 品川
  • 年月日: 2008-12-03
• [学会発表] 夾雑系の有機化学 : 細胞有機化学を目指した悪戦苦闘 (2008)
  • 著者名/発表者名: 浜地 格
  • 学会等名: 東大化学生命専攻ChemBio ハイブリッドレクチャ-
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2008-11-08
• [学会発表] Chemistry-based Protein Labeling (2007)
  • 著者名/発表者名: I. Hamachi
  • 学会等名: 1st Japan-Swiss Chemical Biology Symposium
  • 発表場所: Lausanne, Swiss
  • 年月日: 20070624-25
• [学会発表] Coordination Chemistry-based Protein Labeling (2006)
  • 著者名/発表者名: I. Hamachi
  • 学会等名: 4th Peptide Engineering Meeting
  • 発表場所: Yokohama, Japan
  • 年月日: 20061105-08