ダイズ形質遺伝子座領域の物理地図作製と塩基配列解析

2008 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 18208001
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 独立行政法人農業生物資源研究所 (2007-2009); 千葉大学 (2006)
• 研究代表者: 原田 久也 独立行政法人農業生物資源研究所, ダイズゲノム研究チーム, チーム長 (70011913)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: 植物育種・遺伝 / 植物ゲノム

研究概要

これまでのダイズ形質遺伝子座の解析から、根粒着生制御遺伝子、Nodファクター受容体遺伝子、伸育性制御遺伝子、7Sグロブリン欠失性遺伝子、開花期関連QTL、タンパク質関連QTL等の重要な遺伝子座を同定した。本研究はこれらの遺伝子座の精密マッピングを行い、その近傍領域について、BACクローンのコンティグを作製して、そのうち最も重要と考えられる数百kbの塩基配列を決定する。ホモロジーサーチと遺伝子予測プログラムを併用して、遺伝子構造のモデリング、機能注釈を行い、その領域に存在する遺伝子とその機能を推定する。

研究成果

• [雑誌論文] A novel manual pooling system for preparing three-dimensional pools of a deep coverage soybean bacterial artificial library (2008)
  • 著者名/発表者名: Z. Xia, S. Watanabe, Q. Chen, S. Sato, K.Harada
  • 雑誌名: Molecular Ecology Resources 9 ページ: 516-524
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of the soybean genome using EST-derived microsatellite markers (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Hisano, S. Sato, S. Isobe, S. Sasamoto, T. Wada, A. Matsuno, T. Fujishiro, M. Yamada, S. Nakayama, Y. Nakamura, S. Watanabe, K. Harada, S. Tabata
  • 雑誌名: DNA Research 14 ページ: 271-281
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular characterization of a β-conglycinin deficient soybean (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Tsubokura, M. Hajika, K. Harada
  • 雑誌名: Euphytica 150 ページ: 249-255
  • 査読あり
• [雑誌論文] QTL analysis of resistance to soybean cyst nematode race 3 in soybean cultivar Toyomusume (2006)
  • 著者名/発表者名: S.A. Ferdous, S. Watanabe, C. Suzuki-Orihara, Y. Tanaka, M. Kamiya, N. Yamanaka, K.H arada
  • 雑誌名: Breeding Science 56 ページ: 155-163
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular markers associated with β-conglycinin deficiency in soybean (2006)
  • 著者名/発表者名: Y. Tsubokura, M. Hajika, K. Harada
  • 雑誌名: Breeding Science 56 ページ: 113-117
  • 査読あり
• [学会発表] ダイズリソースの現状とその活用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 原田久也
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] 7Sグロブリン欠失性遺伝子Scg-1座乗領域の構造解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 坪倉康隆・羽鹿牧太・金森裕之・片寄裕 一・原田久也
  • 学会等名: 種子生理生化学研究会
  • 発表場所: マリンヒルホテル小樽
  • 年月日: 2008-10-23
• [学会発表] ダイズの開花期関連遺伝子座FT3のマップベースクローニング (2008)
  • 著者名/発表者名: 渡辺啓史・秀島瑠満子・夏 正俊・坪倉康隆・佐藤修正・山中直樹・石本政男・田畑哲之・穴井豊昭・原田久也
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 滋賀県立大学
  • 年月日: 2008-10-12
• [学会発表] ダイズにおけるゲノム解析基盤の構築とその育種的利用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 原田久也
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 明治大学
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] Fine Mapping toward positional cloning of the FT1 gene for soybean flowering time (2007)
  • 著者名/発表者名: Xia, Z, S. Watanabe, K. Harada
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 山形大学
  • 年月日: 2007-09-22
• [図書] 種子の科学とバイオテクノロジー (2009)
  • 著者名/発表者名: 相田光宏, 原田久也
  • 総ページ数: 379
  • 出版者: 学会出版センター