フタバガキ科の系統地理学的研究と産地識別のための塩基配列データベースの構築

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18255010
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 海外学術
• 研究分野: 林学・森林工学
• 研究機関: 独立行政法人森林総合研究所
• 研究代表者: 津村 義彦 独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 室長 (20353774)
• 研究分担者: 上野 真義 森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員 (40414479) ; 谷 尚樹 国際農林水産業研究センター, 林業領域, 主任研究員 (90343798)
• 連携研究者: 戸丸 信弘 名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (50241774) ; ALFRED Szmidt E. 九州大学, 理学部, 準教授 (70325497) ; 岩田 洋佳 農業・生物特定産業技術研究機構, 中央農研, 主任研究院 (00355489)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• キーワード: フタバガキ科 / 遺伝構造 / 産地識別 / 系統地理 / 遺伝的多様性

研究概要

東南アジアの広域に分布するShorea leprosulaとS.parvifoliaを対象に分布域広域から集団材料を採取し、S.leprosulaではマレー半島、ボルネオ島,スマトラ島、ジャワ島で28集団を収集し、合計で920個体を採取した。S.parvifoliaは同様に4地域で13集団(個体数404個体)を収集した。遺伝解析用のマーカーとしてEST-SSRマーカーを40遺伝子座で開発した。また葉緑体DNA多型のスクリーニングでは17領域を探索して、S.leprosulaでは5領域(trnD-trnT、petB intron、petL-psbE、psbJ-petA、rps16-trnK)で多型がみられ、S.parvifoliaでは4領域(petL-psbE、psbJ-petA、rpl32-trnL、trnQ-rps16)で多型が見られた。22集団のS.leprosulaを34遺伝子座のEST-SSRで解析した結果、遺伝子分化係数はFst=0.0671でボルネオ島の集団とそれ以外が明瞭に分化していた。また葉緑体DNA多型の解析結果は21のハプロタイプが検出され、Fst=0.5851で、遺伝的分化大きく、核DNA同様にボルネオ島の集団とそれ以外が明瞭に分化していた。またボルネオ島の中でも特に東南部は遺伝的多様性が高い傾向が見られた。葉緑体DNAの多型性の結果から、ボルネオ島南部、北部、スマトラ北部などの大きな地域ではDNAによる地域識別が可能であることが示されたが、集団レベルでの識別は難しいとこが明らかとなった。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of 12 microsatellite loci for important tropical tree species Shorea maxwelliana and S. laevis (Dipterocarpaceae) (2010)
  • 著者名/発表者名: Masuda, S., N. Tani, M. Ohtani, Y. Tsumura
  • 雑誌名: Conservation Genetics Resources (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular database for classifying Shorea species (Dipterocarp aceae) and techniques for checking the legitimacy of timber and wood products. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tsumura, Y., T. Kado, K. Yoshida, H. Abe, M. Ohtani, Y. Taguchi, Y. Fukue, N. Tani, S. Ueno, K. Yoshimura, K. Kamiya, K. Harada, Y. Takeuchi, B. Diway, R. Finkeldey, M. Na'iem, S. Indrioko, K.K.S. Ng, N. Muhammad, S.L. Lee
  • 雑誌名: ournal of Plant Research (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] EST-SSRsisolated from Shorea leprosula and their transferability to 36 species within the Dipterocarpaceae. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ng, K.K.S., S.L. Lee, Y. Tsumura, S. Ueno, C.H. Ng, C.T. Lee
  • 雑誌名: Molecular Ecology Resources 9 ページ: 393-398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Paternity analysis-based inference of pollen dispersal patterns, male fecundity variation and influence of flowering tree densities in two dipteroc arp species. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tani, N., Tsumura, Y., Kado, T., Taguchi, Y., Lee, S.L., Muhammad, N., Ng. K.K.S., Numata, S., Nishimura, S., Konuma, A., Okuda, T.
  • 雑誌名: Annals of Botany 104 ページ: 1421-1434
  • 査読あり
• [雑誌論文] Density dependent selfing and its effects on seed performance in a tropicalcanopy tree species, Shorea acuminata (Dipterocarpaceae). (2008)
  • 著者名/発表者名: Naito Y., M. Kanzaki, H. Iwata, K. Obayashi, S.L. Lee, N. Muhammad, T. Okuda, Y. Tsumura
  • 雑誌名: Forest Ecology and Management 256 ページ: 375-383
  • 査読あり
• [雑誌論文] Size-related flowering and fecundity in the tropical canopy tree species (2007)
  • 著者名/発表者名: Naito, Y., M. Kanzaki, S. Numata, K. Obayashi, A. Konuma, S. Nishimura, S. Ohta, Y. Tsumura, T. Okuda, Lee S.L., N. Muhammad
  • 雑誌名: Shorea acuminate (Dipterocarpac eae) during two consecutive general flowerings 121 ページ: 33-42
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of flowering tree-density on mat ing system and gene flow in Shorea lepr osula (Dipterocarpaceae) in Peninsular Malaysia. (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukue, Y., T. Kado, S.L. Lee, K.K.S. Ng, N. Muhammad, Y. Tsumura
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 120 ページ: 413-420
  • 査読あり
• [学会発表] マレー半島におけるフタバガキ科樹木Shorea maxwellianaの遺伝子流動の年次変動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 増田真佑, 谷尚樹, 大谷雅人, 上野真義, Norwati Muhammad, Soon Leong Lee, 津村義彦
  • 学会等名: 日本生態学会
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2010-03-17
• [学会発表] Molecular database for classifying Shorea species (Dipterocarpaceae) and searching the origin of timber in some Shorea species. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tsumura Y., T. Kado, K. Yoshida, H. Abe, M. Ohtani, Y. Taguchi, Y. Fukue, N. Tani, S. Ueno, K. Yoshimura, K. Kamiya, K. Harada, Y. Takeuchi, B. Diway, R. Finkeldey, M. Na' iem, S. Indrioko, K.K.S. Ng, N. Muhammad, S.L. Lee
  • 学会等名: International Forest Genetic Resources Symposium-Conservation and sustainable utilization towards climate change mitigation and adaptation
  • 発表場所: Kuala Lumpur
  • 年月日: 2009-10-06
• [学会発表] 東南アジア熱帯雨林における花粉散布研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷尚樹、角友之、深澤圭太、田口由里子、LeeS。L.、NgK.K.S.、M. Norwati、R. b. Azizi、沼田真也、西村千、小沼明弘、奥田敏統、新山馨、津村義彦
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] マイクロサテライトマーカーを用いたフタバガキ科Shorea maxwellianaの遺伝子流動 (2009)
  • 著者名/発表者名: 増田真佑・谷尚樹・上野真義・Norwati Muhammad・Soon Leong Lee・津村義彦
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] 違法伐採抑止のためのフタバガキ科Shorea属種識別DNAデータベースの構築 (2007)
  • 著者名/発表者名: 津村義彦, 角友之, 福江陽子, 谷直樹, 柴田正志, 上谷浩一, 原田光, 竹内やよい, Diway Bibian, Lee Soon Leong, Norwati Muhammad, Finkeldey Reiner
  • 学会等名: 日本森林学会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 20070402-20070404