• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2007 年度 実績報告書

テーラーメード医療実現に向けての統計的基盤技術の開発と研究

研究課題

研究課題/領域番号 18300095
研究機関広島大学

研究代表者

大瀧 慈  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (20110463)

研究分担者 越智 義道  大分大学, 工学部, 教授 (60185618)
若木 宏文  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (90210856)
柳原 宏和  広島大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (70342615)
和泉 志津恵  大分大学, 工学部, 准教授 (70344413)
濱崎 俊光  大阪大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (40379243)
キーワードアレイデータ / ゲノムデータ / 高次元データ / 数理モデル / テーターメード医療
研究概要

研究代表者の大瀧と研究協力者である大谷らは,平成19年度の研究において,GeneChipマイクロアレイデータに対する新たな数理モデル化を行い,非特異的発現やクロスハイブリダイゼイションを含めた新たな遺伝子発現の定量方式を行った.また,神経芽腫瘍の実データを用いて予後関連の選出を行った.これらの研究成果に一部は論文として公表した.研究分担者の越智は,統計解析の基盤となる計算技術・計算環境に関わる検討と検証を中心に研究を行った.計算技術に関しては,医学生物学データにおける欠測事象,不完全観測に関わる推測の基礎としてのEMアルゴリズムについて検討を行った.和泉は,ケースコントロール法に基づくリスク因子評価法に関する論文を発表した.若木は,特性関数がガンマ関数の比として与えられる統計量の分布の,大標本・高次元の枠組みでの漸近展開のシャープな誤差限界公式が得られている。次元が大きくない場合のカイ二乗タイプの漸近展開に対する同様な誤差限界公式の導出のための,ある種の補題を得た.濱崎は,原点のシフトを伴う変換(シフト変換)のパラメータの推定方注に関する研究を中心に行った.シフト変換への通常の最尤法の適用における尤度の非有界の問題に対処するための方法として,「級わけ尤度に基づく接近」と「間隔積の最大化に基づく方法」をとりあげEMアルゴリズムを利用した推定アルゴリズムを提案した.そして,これらの方法の性能をシミュレーションや現実のデータを通して評価した.柳原は,潜在的な因果関係を推論するための統計モデルの一つである構造方程式モデルの選択問題に関する情報量規準に関する研究を行っている.現在までに,真のモデルがどのようなものであってもリスクのより良い推定量になっているような新しい規準量を提案した.
なお,平成19年度において本研究班は,2008年2月8日(金)-9日(土)に広島県廿日市市宮島口でのシンポジューム「バイオインフォマティックスおよび経時観察データの解析」を主催した.

  • 研究成果

    (20件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] Inference on biological mechanisms using an integrated phenotype prediction model2008

    • 著者名/発表者名
      Enomoto, Y., Ushijima, M., Miyata, S., Matsuura, M., Ohtaki, M
    • 雑誌名

      Hiroshima Journal of Medical Sciences 57

      ページ: 7-15

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A comparison of methods of parameter estimation for the shifted power transformation2008

    • 著者名/発表者名
      Hamasaki, T. and Sugimoto, T.
    • 雑誌名

      Journal of the Japanese Society of Computational Statistics (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selection of a novel drug-response predictor in esophageal cancer: A novel screening method using microarray and identification of IFITM1 as a potent marker gene of CDDP response.2007

    • 著者名/発表者名
      Fumoto, S., Shimokuni, T., Tanimoto, K., Hiyama, K. Otani, K., Ohtaki, M., Hihara, J., Yoshida, K., Hiyama, E., Noguchi, T., and Nishiyama, M
    • 雑誌名

      International Journal of Oncology 32

      ページ: 423-433

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Incorporation of inter-individual heterogeneity into the multistage carcinogenesis model: approach to the analysis of cancer incidence data2007

    • 著者名/発表者名
      Izumi, S. and Ohtaki, M.
    • 雑誌名

      Biometrical Journal 49

      ページ: 539-550

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A mathematical model for Affymetrix Genecip probe level data2007

    • 著者名/発表者名
      Otani K, Hiyama K., Satoh, K, Shimamoto, T., Mohamad D., Ando, M., Tonda, T., Kohda, M., OKazaki, Y., Nishiyama, M., Hiyama, E. and Ohtaki, M
    • 雑誌名

      JP Journal of Biostatistics 1

      ページ: 283-306

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A family of estimators for multivariate kurtosis in a nonnormal linear regression model2007

    • 著者名/発表者名
      Yanagihara, H.
    • 雑誌名

      Journal of Multivariate Analysis 98

      ページ: 1-29

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Box and Cox power-transformation to confined and censored nonnormal responses in regression2007

    • 著者名/発表者名
      Hamasaki, T. and Kim S. Y.
    • 雑誌名

      Computational Statistics & Data Analysis 51

      ページ: 3788-3799

    • 査読あり
  • [雑誌論文] サンプリングデザイン:カウンターマッチング2007

    • 著者名/発表者名
      藤井良宜, コローン ジヨン, 和泉志津恵
    • 雑誌名

      計量生物学 28

      ページ: 47-58

    • 査読あり
  • [学会発表] コホート内サブ研究における遺伝的及び環境的因子の交互作用の評価について2008

    • 著者名/発表者名
      和泉志津恵
    • 学会等名
      平成19年度統計数理研究所・公開研究会「生物統計学における因果推論に関する手法の改善」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-03-25
  • [学会発表] 遺伝子型の一致率によるQuality Control2008

    • 著者名/発表者名
      安東正貴, 佐藤泰憲, 坂本裕美, 吉田輝彦, 大瀧 慈
    • 学会等名
      科研費シンポジウム「バイオインフォマティックスおよび経時観察データの解析」
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2008-02-09
  • [学会発表] マイクロアレイデータによる神経芽細胞腫関連遺伝子の探索2008

    • 著者名/発表者名
      大谷敬子, 大瀧 慈, 檜山英三, 檜山桂子, 佐藤健一, 冨田哲治
    • 学会等名
      科研費シンポジューム「バイオインフォマテイックスおよび掲示観察データの解析」
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2008-02-08
  • [学会発表] Two Dimensional Summarization for Affymetrix GeneChip Probe Level Data based on Functional States of Gene-ON/OFF2007

    • 著者名/発表者名
      Otani K., Ohtaki M., Hiyama K., Satoh K. and Hiyama E.
    • 学会等名
      East Asia Regional Biometric Conference
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-12-10
  • [学会発表] Estimating the power of the likelihood ratio test in the cohort based nested case-control studies2007

    • 著者名/発表者名
      Izumi S, Fujii Y
    • 学会等名
      East Asia Regional Biometric Conference 2007
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-12-10
  • [学会発表] A Mathematical model for affymetrix genechip probe level data based on functional states of gene-ON/OFF2007

    • 著者名/発表者名
      Otani K., Ohtaki M., Hiyama K., Hiyama E., Satoh K., Shimamoto T., Dokhi M., Andoh M., Tonda T., Nishiyama M.
    • 学会等名
      21st International Mammalian Genome Conference
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2007-10-31
  • [学会発表] 構造方程式モデルを用いた因果推論2007

    • 著者名/発表者名
      和泉志津恵, 原 恭彦, 小畑経史
    • 学会等名
      大分統計談話会第35回・科研費(A)シンポジューム
    • 発表場所
      大分
    • 年月日
      2007-10-18
  • [学会発表] Mutations of p53 gene in non-small cell lung cancer among a tomic-bomb survivors2007

    • 著者名/発表者名
      Taga M, Eguchi H, Hamatani K, Ito R, Imai K, Katayama K, Nishi N, Tahara E, Izumi S, Matsumura S, Oue N, Yasui W, Nakachi K
    • 学会等名
      第66回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-10-05
  • [学会発表] Gene alterations relative to microsatellite instability in colorectal cancer among atomic-bomb survivors2007

    • 著者名/発表者名
      Eguchi H, Hamatani K, Taga M, Ito R, Takahashi K, Nishi N, Katayama H, Tahara E, Izumi S, Matsumura S, Oue N, Yasui W, Nakachi K
    • 学会等名
      第66回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-10-04
  • [学会発表] コホート内症例対照研究における対照選択デザイン2007

    • 著者名/発表者名
      藤井良宜, 和泉志津恵
    • 学会等名
      科研費(B)シンポジューム
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-09-18
  • [学会発表] 'ON/OFF'に基づくマイクロアレイデータの数理特性に関する検討-解析の可能性と限界2007

    • 著者名/発表者名
      大谷敬子, 大瀧 慈, 佐藤健一, 西山正彦, 檜山桂子, 島本武嗣, モハマッドドキ, 岡崎康司
    • 学会等名
      2007年度統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2007-09-07
  • [学会発表] コホート内症例対照研究における検出力の推定方法2007

    • 著者名/発表者名
      和泉志津恵, 藤井良宜
    • 学会等名
      2007年度統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2007-09-07

URL: 

公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi