気候関連ガスの動態を左右する海洋微生物系統群の解析

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18310011
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 環境動態解析
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 浜崎 恒二 東京大学, 海洋研究所, 准教授 (80277871)
• 研究分担者: 永田 俊 東京大学, 海洋研究所, 教授 (40183892)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• キーワード: 海洋 / 微生物 / 炭素循環 / ジメチルサルファイド

研究概要

本研究では、海洋微生物の生態を解析するための新しい手法を開発し、これらを駆使して、海洋における炭酸ガスやジメチルサルファイド(DMS)といった気候関連ガスの動態に強い影響を及ぼす微生物鍵種を特定した。さらに、独自技術に次世代超並列シーケンスを組み合わせた解析では、従来法では不可能であった希少種も含めた増殖群の特定に成功し、微生物多様性と生態系の安定性を議論する上での重要な知見を得ることが出来た。

研究成果

• [雑誌論文] Community structures of actively growing bacteria shift along a north-south transect in the western North Pacific (2008)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi, A., Hamasaki, K.
  • 雑誌名: Environ Microb. 10 ページ: 1007-1017
  • 査読あり
• [雑誌論文] 海洋における光合成細菌の分布と微生物海洋学への展望 (2007)
  • 著者名/発表者名: 浜崎恒二
  • 雑誌名: 日本微生物生態学会誌 22 ページ: 5-14
• [雑誌論文] Actively growing bacteria in the Inland Sea of Japan identified by combined bromodeoxyuridine immunocapture and denaturing gradient gel electrophoresis (2007)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K., Taniguchi, A., Tada, Y., Long, RA, Azam, F.
  • 雑誌名: Appl. Environ. Microbiol 73 ページ: 2787-2798
  • 査読あり
• [雑誌論文] Size distribution and biomass of nanoflagellates in meso-and bathypelagic layers of the subarctic Pacific (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukuda, H., Sohrin, R., Nagata, T., Koike, I.
  • 雑誌名: Aquatic Microbial Ecology 46 ページ: 203-207
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of viral production by addition of nitrogen or nitrogen plus carbon in subtropical surface waters of the South Pacific (2007)
  • 著者名/発表者名: Motegi, C., Nagata, T.
  • 雑誌名: Aquatic Microbial Ecology 48 ページ: 27-34
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of bromodeoxyuridine immunoassay with tritiated thymidine radioassay for measuring bacterial productivity in oceanic waters (2006)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K
  • 雑誌名: J. Oceanogr. J. Oceanogr 62 ページ: 793-799
  • 査読あり
• [学会発表] Diversity of active microbial communities in surface seawaters along a north-south transect in the South Pacific Ocean (2009)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K, Taniguchi, A
  • 学会等名: International Census of Marine Microbes 454 Users Spring Meeting, Woods Hole
  • 年月日: 20090406-09
• [学会発表] Distribution and abundance of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in temperate neritic water of the Otsuchi Bay, northern Japan (2009)
  • 著者名/発表者名: Sato, Y, Fukuda, H, Hamasaki, K
  • 学会等名: ASLO aquatic science meeting
  • 発表場所: Niece
  • 年月日: 20090200
• [学会発表] Drastic change of the biomass and productivity of major subgroups of bacteria along a steep environmental gradient in the Southern Ocean frontal systems (2009)
  • 著者名/発表者名: Tada, Y, Taniguchi A, Hamasaki, K
  • 学会等名: SCAR Biology Symposium, Sapporo
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] Identification of actively growing bacteria in seawater supplemented with dimethylsulfoniopropionate (DMSP) in the Southern Ocean (2009)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, A, Tada, Y, Kasamatsu, N, Hamasaki, K
  • 学会等名: SCAR Biology Symposium, Sapporo
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] 西部北太平洋植物プランクトンブルームにおける細菌群集の動態解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 多田雄哉, 谷口亮人, 津田敦, 植松光夫, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 2009
  • 年月日: 20090000
• [学会発表] Massively Parallel Sequencing of 16S rRNA V6 Regions Revealed the Diversity of Active-but-Rare Microbial Populations in Oceanic Pelagic Ecosystems (2009)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K, Taniguchi, A
  • 学会等名: 1st Korea-Japan Symposium on Microbial Ecology, Jeju
  • 年月日: 2009-05-29
• [学会発表] Diversity of active microbial communities in the South Pacific Ocean revealed by bromodeoxyuridine labeling and 454 tag sequencing technology (2009)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K, Taniguchi, A
  • 学会等名: DNA Barcoding of Marine Biodiversity (MarBOL)
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2009-05-21
• [学会発表] 中栄養沿岸域における酸素非発生型好気性光合成細菌の現存量の変動 (2008)
  • 著者名/発表者名: 佐藤由季, 福田秀樹, 谷口亮人, 吉田典明, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本微生物生態学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20081000
• [学会発表] サロマ湖海氷細菌群集構造解析-極域海氷細菌群はサロマ湖海氷で生きていけるか- (2008)
  • 著者名/発表者名: 谷口亮人, 多田雄哉, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 20080924-28
• [学会発表] 植物プランクトンブルーム崩壊過程における細菌群集の動態解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 多田雄哉, 谷口亮人, 吉田典明, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 広島
  • 年月日: 20080924-28
• [学会発表] Bacterial colonization and luminescence on fecal pellets of macrozooplankton (2008)
  • 著者名/発表者名: Tada, Y, Wada, M, Nishikawa, J, Hamasaki, K.
  • 学会等名: 12th International Symposium on Microbial Ecology, Cairns
  • 年月日: 20080820-24
• [学会発表] 西部北太平洋における植物プランクトンブルーム内外の細菌群集構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 多田雄哉, 谷口亮人, 津田敦, 植松光夫, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20080300
• [学会発表] 海洋細菌によるサブミクロン粒子捕獲量と分解酵素活性 (2008)
  • 著者名/発表者名: 菅友美, 大林由美子, 池本栄子, 菊池知彦, 浜崎恒二, 木暮一啓
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20080300
• [学会発表] 相模湾西部沿岸域における従属栄養性細菌の時空間変動解析 特にその生産力と群集構造について (2008)
  • 著者名/発表者名: 寺西聡子, 谷口亮人, 浜崎恒二, 菊池知彦
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20080300
• [学会発表] Bacterial community structures and luminescence of the fecal pellets of Antarctic krill and salps (2008)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa, J, Tada, Y, Wada, M, Hamasaki, K.
  • 学会等名: XXXI Symposium on Polar Biology
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2008-12-05
• [学会発表] 大規模南北トランゼクトにおける細菌群集構造の空間的変動 (2007)
  • 著者名/発表者名: 谷口亮人, 多田雄哉, 横川太一, 茂手木千晶, ヤン・ヤンヒュイ, 永田俊, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 沖縄
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 海洋中のサブミクロン粒子を捕獲する細菌の分布と現存量 (2007)
  • 著者名/発表者名: 菅友美, 徐維那, 池本栄子, 谷口亮人, 多田雄哉, 寺西聡子, 浜崎恒二, 菊池知彦, 木暮一啓
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 沖縄
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] サルパ類糞粒中の微生物叢の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 浜崎恒二, 多田雄哉, 和田実, 西川淳
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 沖縄
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 岩手県大槌湾における酸素非発生型好気性光合成細菌の分離と現存量の推定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 佐藤由季, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本海洋学会
  • 発表場所: 沖縄
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] マイクロビーズアレイシステムを用いた海洋細菌の群集構造解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 多田雄哉, 谷口亮人, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本微生物生態学会
  • 発表場所: 愛媛
  • 年月日: 20070900
• [学会発表] 植物プランクトンブルームの形成・崩壊過程における細菌群集の変動-BUMP-DGGE法による解析- (2006)
  • 著者名/発表者名: 谷口亮人, 多田雄哉, 浜崎恒二, 横川太一, 茂手木千晶, 永田俊
  • 学会等名: 日本微生物生態学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20061000
• [学会発表] 多田雄哉, 広島湾において活発に増殖する細菌系統群の季節変動谷口亮人, 浜崎恒二 (2006)
  • 著者名/発表者名: 多田雄哉, 谷口亮人, 浜崎恒二
  • 学会等名: 日本微生物生態学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20061000
• [学会発表] Bacterial growth response in seawater environments : application of halogenated nucleoside, bromodeoxyuridine incorporation (2006)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K
  • 学会等名: 2^<nd> KIOS-ORI Joint Symposium on Marine Science, Pusan
  • 年月日: 20060922-23
• [学会発表] Monitoring key phylogenetic groups responsible for bacterial production in coastal seawater (2006)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki, K, Tada, Y, Taniguchi, A
  • 学会等名: 11^<th> International Symposium on Microbial Ecology
  • 発表場所: Vienna
  • 年月日: 20060800
• [学会発表] Determining key species responsible for bacterial production in coastal and oceanic waters (2006)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi, A, Hamasaki, K
  • 学会等名: 11^<th> International Symposium on Microbial Ecology, Vienna
  • 年月日: 20060800