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(1)非病原力遺伝子周辺領域の構造変異の順序予測は正しいか。
筆者は、いもち病菌の非病原力遺伝子の転移過程にっいて、「レトロトランスポゾンの非病原力遺伝子flankへの挿入とそれを利用した彷徨」というひとつの仮説を提示した。これが正しいならば、非病原力遺伝子AVR-Pita本体そのものの進化もこの順序になっているはずである。これを検証するため、多数の各種菌株からAVR-PitaホモログORFをPCRで増幅し、ダイレクトシークエンスし、系統解析を行った。その結果、予想どおり、Cenchrus菌のホモログ(flanking regionにレトロトランスポゾンの痕跡が皆無)がもっとも系統樹の根に近く、その次にメヒシバ菌のホモログ(Flanking region両側にレトロトランスポゾンの本体が存在)、その次にキビ菌とエノコログサ菌のホモログ(Flanking region片側にレトロトランスポゾンの本体が存在)、最後にイネ菌とアワ菌のホモログ(Flanking region片側にレトロトランスポゾンのLTRが存在)となった。
(2)非病原力遺伝子彷徨の過程におけるアミノ酸置換と機能の関連
それぞれの菌からクローニングしたAVR-Pitaホモログを、イネ菌P2-b (Pita保有イネ品種ヤシロモチに病原性)に導入し、形質転換体を計200菌系作出した。現在、これらをヤシロモチに接種し、非病原性になるかどうかを検討している。
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