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2008 年度 実績報告書

水田表面水中のウィルスの生態

研究課題

研究課題/領域番号 18380051
研究機関名古屋大学

研究代表者

木村 眞人  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (20092190)

キーワード細菌 / ファージ / 表面水 / 季節変動 / 感染 / 透過型電子顕微鏡 / 環境DNA / Sphingomonas
研究概要

1) 水田表面水中のファージ群集の特徴を明らかにするため、同一圃場から作土還元層を採取し、そのg23遺伝子の多様性を水田表面水中のファージの多様性と比較した結果、その多様性が類似するとともに、水田表面水中のg23遺伝子に類似した塩基配列が得られた。
2) さらに、全国の水田土壌中のg23遺伝子を探索し、青森、秋田、愛知、福岡の各水田土壌中には、類似したg23遺伝子の存在することが明らかとなった。本結果は、ファージの宿主特異性を考えるとき、きわめて興味深い結果であった。
3) このような水田におけるg23遺伝子が中国東北部の水田においても当てはまるか否かを調査した。その結果、わが国と中国東北部に特有のg23遺伝子の塩基配列が観察されたものの、大半のg23遺伝子の塩基配列は、共通するものであった。
4) 昨年度、Sphingomonas属菌に感染するファージ群集を分離し、g23遺伝子の塩基配列の多様性が極めて大きいことを明らかにした。今年度は分離に使用した水田表面水を供試し、表面水から直接DNAを抽出後にg23遺伝子に特異的なプライマーを用いてPCR増幅後、各クローンの多様性をSphingomonas属菌に感染するファージの多様性と比較した結果、その多様性は、Sphingomonas属菌に感染するファージ群集と類似しており、Sphingomonas属菌に感染するファージ群集の多様性が、水田表面水中のg23遺伝子の多様性に匹敵することが判明した。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Diversity of major capsid genes (g23)of T4-type bacteriophages in Japanese paddy field soils.2009

    • 著者名/発表者名
      Guanghua Wang
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 13-20

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of g23 gene sequence diversity between Novosphingobium and Sphingomonas phages and phage communities in the floodwater of a Japanese paddy field.2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 179-185

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Frequency of phage-infected bacterial cells in the floodwater of a Japanese paddy field2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 186-191

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Morphology, host range and phylogenetic diversity of Sphingomonas phaees in the floodwater of a Japanese paddy field.2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 55

      ページ: 53-64

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Survey of major capsid genes (g23)of T4-type bacteriophages in rice fields in Northeast China2009

    • 著者名/発表者名
      Guanghua Wang
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 446-447

    • 査読あり
  • [学会発表] 水田表面水におけるファージ群集とNovosphingobium/Sphingomonasファージのg23遺伝子の多様性2008

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2008年度大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-09-11

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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