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2007 年度 実績報告書

未開拓遺伝子資源を利用した細菌の有機塩素系環境汚染物質浄化能力の総合的開発

研究課題

研究課題/領域番号 18380054
研究機関東北大学

研究代表者

永田 裕二  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 准教授 (30237531)

研究分担者 津田 雅孝  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (90172022)
キーワード酵素 / 細菌 / バイオテクノロジー / 微生物 / 環境汚染物質
研究概要

本研究では、環境汚染が深刻な代表的な有機塩素系殺虫剤に焦点をあて、(i)難培養性微生物の遺伝情報も含む未開拓な遺伝子資源から新規の分解酵素遺伝子の取得、(ii)有機塩素系環境汚染物質分解の鍵酵素である脱ハロゲン酵素の機能改良、(iii)直接の分解酵素以外で分解活性の発現に必須な細胞因子の同定、(iv)有効な有機塩素系化合物の生分解システムの構築、を実施し、環境細菌が有する高度難分解性有機塩素系化合物の分解能力を正確に把握し、これを総合的に開発することで環境浄化へ結びつけることを目的とする。本年度の主な成果は以下の通りである。
1)ハロアルカンデハロゲナーゼLinBが重要な環境汚染物質である1,2,3-trichloropropaneに対して微弱な分解活性を有することを見出した。
2)根粒菌由来のLinBホモログであるDbjAの結晶化、および立体構造解析に成功した。
3)環境汚染物質分解に関わるプラスミドpWW53の全塩基配列を解読すると共に、可動性遺伝因子を介したプラスミドゲノムの構成原理を解明した。
4)γ-HCH分解菌UT26株のγ-HCH資化能に必須なABCトランスポーターが、外膜の性質を変えることにより、γ-HCH代謝の際に生じる毒性物質の耐性能に関与していることを解明した。
5)有機塩素系殺虫剤HCH汚染土壌より単離した細菌MI1205株が保持するLinB-MIが、UT26株由来のLinB-UTと7アミノ酸残基のみの違いにも関わらず、(i)β-HCHに対する顕著に強い分解活性、(ii)PCHLをさらにTCDLにまで変換する活性、というLinB-UTにはない特性を有することを精製酵素を用いて解明し、さらに、活性の違いに重要なアミノ酸残基の同定を実施した。
6)カイメン共在細菌メタゲノムより新規ハロアルカンデハロゲナーゼ遺伝子を取得した。

  • 研究成果

    (38件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (28件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Weak activity of haloalkane dehalogenase LinB with 1,2,3-trichloropropane revealed by X-ray crystallography and microcalorimetry2007

    • 著者名/発表者名
      Monincova, M., et. al.
    • 雑誌名

      Appl. Envirom. Microbiol. 73

      ページ: 2005-2008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a haloalkane dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA1102007

    • 著者名/発表者名
      Sato, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Acta Cryst Section F 63

      ページ: 294-296

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete sequence determination combinedwith analysis of transposition/site-specific recombination events toexplain genetic organization of IncP-7 TOL plasmid pWW53 and related mobile genetic elements2007

    • 著者名/発表者名
      Yano, H., et. al.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 369

      ページ: 11-26

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification and characterization of genes encoding a putative ABC-type transporter essential for the utilization of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium Japonicum UT262007

    • 著者名/発表者名
      Endo, R., et. al.
    • 雑誌名

      J. Bacteriol. 189

      ページ: 3712-3720

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from γ-hexachlorocyclohexane-utilizing bacterium Sphingobium sp. MI12052007

    • 著者名/発表者名
      Ito, M., et. al.
    • 雑誌名

      Arch. Microbiol. 188

      ページ: 313-325

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Appl. Microbiol. and Biotechnol. 76

      ページ: 741-752

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 自然環境で実際に機能する微生物遺伝子の遺伝学的手法による検索と解析2007

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 雑誌名

      化学と生物 45

      ページ: 557-563

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 雑誌名

      J. Environ. Biotechnol. 7

      ページ: 75-78

    • 査読あり
  • [学会発表] スロット部の改変により1,2,3-trichloropropane分解活性を強化した変異型ハロアルカン脱ハロゲン酵素DhaAの解析2008

    • 著者名/発表者名
      M. Pavlova, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] gamma-HCH分解細菌Sphingomonas sp. MM-1株のgamma-HCH分解関連プラスミドの解析2008

    • 著者名/発表者名
      田端理朗, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] モデル土壌の有機塩素系殺虫剤gamma-HCHによる人工的汚染化に関する研究2008

    • 著者名/発表者名
      府中玄樹, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] Signature-tagged mutagenesisによるBurkholderia multivorans ATCC17616株の土壌環境生残必須遺伝子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      宮腰昌利, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に関与する受容菌側因子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      宮崎亮, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] 2種の土壌細菌においてカタボライト調節をおこす抑制基質の解析2008

    • 著者名/発表者名
      石塚真祐子, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] ハロアルカン脱ハロゲン酵素LinBの数アミノ酸の分岐を促した環境要因の探索2008

    • 著者名/発表者名
      伊藤通浩, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] 比較ゲノム解析用ソフトウエアGenomeMatcherの開発2008

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] Pseudomonas putida mt-2由来のTn3型トランスポゾンTn4651のcointegrate-resolutionに関与するシス・エレメントの解析2008

    • 著者名/発表者名
      矢野大和, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] スフィンゴビウム属細菌の細胞外膜安定性に関わるABCトランスポーター2008

    • 著者名/発表者名
      遠藤諒, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] Pseudomonas putidaHS1株由来のトルエン分解プラスミドpDK1のゲノム解析2008

    • 著者名/発表者名
      長田和也, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      20080326-29
  • [学会発表] GenomeMatcher比較ゲノム用ソフトウエア2008

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      20080306-08
  • [学会発表] Pseudomonas putida KT2440株のゲノミックアイランドに存在するparAホモログのIncP-7群プラスミドによる転写誘導2008

    • 著者名/発表者名
      宮腰昌利, ら
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      20080306-08
  • [学会発表] プラスミドの接合伝達に関与する受容菌側因子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      宮崎亮, ら
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      20080306-08
  • [学会発表] スフィンゴモナス属類縁細菌群の多彩な難分解性物質分解能を支えるゲノム的基盤2008

    • 著者名/発表者名
      永田 裕二, ら
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      20080306-08
  • [学会発表] スフィンゴモナス属細菌の細胞膜の安定性に関わる新規ABCトランスポーター2007

    • 著者名/発表者名
      遠藤諒, ら
    • 学会等名
      第30回分子生物学会年会・第80回生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜市 パシフィコ横浜
    • 年月日
      20071211-15
  • [学会発表] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 学会等名
      第59回日本生物工学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      広島大学東広島キャンパス
    • 年月日
      20070925-27
  • [学会発表] カイメン共在細菌メタゲノム中のハロアルカン脱ハロゲン酵素遺伝子相同配列の解析2007

    • 著者名/発表者名
      荒井保亮, ら
    • 学会等名
      第59回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      広島大学東広島キャンパス
    • 年月日
      20070925-27
  • [学会発表] インドの高濃度HCH汚染根圏土壌から取得されたγ-HCH分解資化細菌Sphingomonas sp. MM-1株のγ-HCH分解関与遺伝子群に関する研究2007

    • 著者名/発表者名
      田端理朗, ら
    • 学会等名
      第59回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      広島大学東広島キャンパス
    • 年月日
      20070925-27
  • [学会発表] 培養非依存的手法による土壌環境からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得2007

    • 著者名/発表者名
      永田裕二, ら
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第23回大会シンポジウム
    • 発表場所
      愛媛大学城北キャンパス
    • 年月日
      20070915-18
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCHによる土壌の試験的汚染化に関する研究2007

    • 著者名/発表者名
      府中玄樹, ら
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第23回大会
    • 発表場所
      愛媛大学城北キャンパス
    • 年月日
      20070915-18
  • [学会発表] Signature-tagged mutagenesis法によるBurkholderia multivorans ATCC17616株の土壌環境必須遺伝子の同定2007

    • 著者名/発表者名
      宮腰昌利, ら
    • 学会等名
      第23回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      愛媛大学城北キャンパス
    • 年月日
      20070915-18
  • [学会発表] カイメン共在細菌メタゲノム由来のメタ開裂酵素遺伝子の取得と解析2007

    • 著者名/発表者名
      渡邊洋平, ら
    • 学会等名
      第23回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      愛媛大学城北キャンパス
    • 年月日
      20070915-18
  • [学会発表] メタゲノム的手法による土壌からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得と解析2007

    • 著者名/発表者名
      小野玲, ら
    • 学会等名
      第23回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      愛媛大学城北キャンパス
    • 年月日
      20070915-18
  • [学会発表] Characterization of the traD gene cluster involved in the conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72007

    • 著者名/発表者名
      R. Miyazaki, ら
    • 学会等名
      ASM Conference on Pseudomonas 2007
    • 発表場所
      Seattle, Washington, USA
    • 年月日
      20070826-30
  • [学会発表] Functional screening of genes for aromatic ring-hydroxylating oxygenases from soil metagenomic libraries2007

    • 著者名/発表者名
      A. Ono, ら
    • 学会等名
      Metagenomics 2007
    • 発表場所
      San Diego, California, USA
    • 年月日
      20070711-13
  • [学会発表] Haloalkane Dehalogenases Possess Two Different Structural Bases for Their Enantioselectivity2007

    • 著者名/発表者名
      Z. Prokop, ら
    • 学会等名
      BIOTRANS 2007-8th International Symposium on Biocatalysis and Biotransformations
    • 発表場所
      Oviedo, Spain
    • 年月日
      20070708-13
  • [学会発表] 生態系での細菌ゲノム情報発現-遺伝学的手法を用いた発現遺伝子群の探索-2007

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 学会等名
      極限環境微生物学会第8回シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学すずかけ台キャンパス
    • 年月日
      2007-07-03
  • [図書] バイオフィルムの基礎と制御(部分執筆)2008

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、津田雅孝
    • 総ページ数
      399
    • 出版者
      株式会社エヌ・ティー・エス
  • [図書] 比較ゲノム学から読み解く生命システム〜基本概念から最新ゲノム情報まで(部分執筆)2007

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 総ページ数
      196
    • 出版者
      秀潤社

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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