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2006 年度 実績報告書

タンパク質分解における糖鎖修飾系とユビキチン修飾系のクロストークの構造的基盤

研究課題

研究課題/領域番号 18390016
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

加藤 晃一  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 教授 (20211849)

研究分担者 山口 芳樹  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 講師 (90323451)
栗本 英治  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 助手 (90234575)
キーワードタンパク質分解 / 糖鎖 / ユビキチン / NMR / 構造生物学
研究概要

1.糖鎖ライブラリーの作成とPNGaseの糖鎖認識特異性の解析
鶏卵由来の免疫グロブリンYなどを原材料として、多次元HPLCマップ法により高マンノース型糖鎖のライブラリーを作成した。一方、peptide : N-glycanase(PNGase)のレクチンドメインを大腸菌を利用して発現した。これを用いて糖鎖との相互作用をフロンタルアフィニティークロマトグラフィー(FAC)法により系統的に解析し、糖鎖認識の特異性を明らかにした。小胞体関連分解にかかわる種々の細胞内レクチンについても組換えタンパク質を調製し、糖鎖結合特性の系統的解析を実施するための基盤を整備した。
2.ポリユビキチン鎖とPNaseの相互作用解析
一定の重合度のポリユビキチン鎖を酵素反応とHPLCを利用して調製した。これにより得られた様々な長さのポリユビキチン鎖(Ub, Ub_2,Ub_3)とPNGaseのPUBドメインとの相互作用をFAC法により解析した。その結果より、ユビキチン鎖の鎖長の増大とともに、PUBドメインとユビキチン鎖との親和性が増大することが判明した。また、ポリユビキチン鎖とPNaseのNMRによる相互作用解析を行うために、特定の位置のユビキチンに安定同位体標識を施したポリユビキチン鎖の大量調製を行うことに成功した。ユニット特異的に安定同位体標識を施したユビキチン鎖の調製により、詳細なNMR解析が実現可能となった。このようにPNGaseのPUBドメインとユビキチン鎖との詳細な相互作用解析を行うための研究環境を整えることができた。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] 糖鎖構造解析の臨床応用2007

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和
    • 雑誌名

      分子細胞治療 6

      ページ: 36-42

  • [雑誌論文] NMRによる糖鎖-タンパク質相互作用の解析2007

    • 著者名/発表者名
      山口芳樹
    • 雑誌名

      実験医学 25

      ページ: 1137-1144

  • [雑誌論文] Structural views of glycoprotein-fate determination in cells2007

    • 著者名/発表者名
      K.Kato
    • 雑誌名

      Glycobiology (in press)

  • [雑誌論文] Solution structure and dynamics of Ufm1, a ubiquitin-fold modifier 12006

    • 著者名/発表者名
      H.Sasakawa
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun 343

      ページ: 21-26

  • [雑誌論文] Sugar recognition by intracellular lectins that determine the fates of glycoproteins2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Kamiya
    • 雑誌名

      Trends Glycosci. Glycotech. 18

      ページ: 231-244

  • [雑誌論文] 構造生物学から見たユビキチン系2006

    • 著者名/発表者名
      坂田絵里
    • 雑誌名

      蛋白質 核酸 酵素 51

      ページ: 1134-1142

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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