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2006 年度 実績報告書

標的蛋白質を用いたパターン認識による癌診断システムの開発

研究課題

研究課題/領域番号 18500132
研究種目

基盤研究(C)

研究機関山口大学

研究代表者

浜本 義彦  山口大学, 大学院医学系研究科, 教授 (90198820)

研究分担者 平林 晃  山口大学, 大学院医学系研究科, 助教授 (50272688)
内村 俊二  山口大学, 大学院医学系研究科, 助手 (50203550)
中村 和行  山口大学, 大学院医学系研究科, 教授 (90107748)
蔵満 保宏  山口大学, 大学院医学系研究科, 助教授 (50281811)
飯塚 徳男  山口大学, 医学部, 助手 (80332807)
キーワードパターン認識 / 癌 / プロテオーム / 診断
研究概要

中村、蔵満、飯塚から提供された肝臓癌の癌部と非癌部の対となるゲル画像8枚を用いて、浜本、内村、平林でスポット検出のアルゴリズムを検討した。
まず、微量なスポットを検出するため、ゲル画像に前処理を施すことを検討した。ノイズ除去などの平滑化処理、コンストラスト(濃度)補正処理、鮮鋭化処理など様々な処理を組み合わせてスポット検出に有効な前処理を網羅的に検討した。その結果、動的しきい値法を経てヒストグラム平滑化処理が有効であることが判明した。
続いて、微量なスポットを検出するため、ガウス型テンプレートを用いたスポット検出法を検討し、目視で確認できるスポットをほぼ検出することができた。
最後に、特異的スポット検出法を検討した。対象となるスポットを点集合と見なし、文字認識で用いられる局所アフィン変換によるゲル画像間のスポット対応付けを行い、特異的スポット検出を試みた。8枚のゲル画像を16分割し、計128枚のゲル画像を実験に用いた。その結果、目視での正解に対し主要な特異的スポットを検出することができ、特異的スポット検出の見通しを得た。

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (2件)

  • [雑誌論文] 二次元電気泳動画像を対象とした前処理に関する一考察2007

    • 著者名/発表者名
      林 孝哉
    • 雑誌名

      情報処理学会第69回全国大会講演論文集 3J-4

      ページ: 439-440

  • [雑誌論文] スポット検出のためのフィルタリングによるゲル画像の処理2006

    • 著者名/発表者名
      林 孝哉
    • 雑誌名

      平成18年度電気・情報関連学会中国支部第57回連合大会講演論文集

      ページ: 144-144

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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