標的タンパク質との複合体における低親和性リード化合物の高感度

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18550082
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分析化学
• 研究機関: 明星大学
• 研究代表者: 田代 充 明星大学, 理工学部化学科, 准教授 (40315750)
• 研究分担者: 吉村 悦郎 東京大学, 農学生命科学, 教授 (10130303)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• キーワード: 生物学的分析 / 高感度選択的検出

研究概要

レセプターであるタンパク質と、それに対して低い親和性をもつ低分子化合物との相互作用解析を行うための検出方法の開発を行った。分析機器として核磁気共鳴法を用い、Water-LOGSY法をべースに、選択的に水シグナルを励起するパルス系列を開発し、親和性のあるリード化合物を選択的に検出することが可能になった。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of the molecular reorientational dynamics of the neat ionic liquid 1-butyl-3-methylimidazolium bromide in the super cooled state using 1H and 13C NMR spectroscopy (2009)
  • 著者名/発表者名: Mamoru Imanari, Hiroyuki Tsuchiya, Hiroko Seki, Keiko Nishikawa and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem. 47 ページ: 67-70
  • 査読あり
• [雑誌論文] Specific interactions between Silver(I) Ions and Cytosine? Cytosine Pairs in DNA Duplexes (2008)
  • 著者名/発表者名: Akira Ono, Shiqi Cao, Humika Togashi, Mitsuru Tashiro, Takashi Fujimoto, Tomoya Machinami, Shuji Oda, Yoko Miyake, Itaru Okamoto and Yoshiyuki Tanaka
  • 雑誌名: Chem. Comm. ページ: 4825-4827
  • 査読あり
• [雑誌論文] An efficient use of the WATERGATE W5 sequence for observing a ligand binding with a protein receptor (2008)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Furihata, Sakurako Shimotakahara and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem. 46 ページ: 799-802
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR study for self aggregation of 1-butyl-3-methylimidazolium bromide in aqueous solution (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Tsuchiya, Mamoru Imanari, Shinji Ishihara, Masamichi Nakakoshi, Keiko Nishikawa, Hiroko Seki, and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: Anal. Sci. 24 ページ: 1369-1371
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of fibrillation process of α-synuclein at the initial stage (2008)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Tashiro, Masaki Kojima, Hiroshi Kihara, Kouki Kasai, Tomoaki Kamiyoshihara, Kenji Ueda, and Sakurako Shimotakahara
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 369 ページ: 910-914
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal Structures of 1-Isopropyl-3-methylimidazolium Iodide and 2,3 -Dimethy-1-isopropylimidazolium Iodide (2007)
  • 著者名/発表者名: Takashi Fujimoto, Masatoshi Kawahata, Masamichi Nakakoshi, Tomoya Machinami, Hiroko Seki and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: Anal. Sci. 23 ページ: x223-x224
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expression and characterization of a pleckstrin homology domain in phospholipase C, PLC-η1 (2007)
  • 著者名/発表者名: Toru Imai, Kouki Kasai, Junichi Kurita, Kiyoko Fukami, Mitsuru Tashiro, and Sakurako Shimotakahara
  • 雑誌名: Protein Express. Purif. 56 ページ: 247-252
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reduction of aluminum toxicity by 2-isopropylmalic acid in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae (2007)
  • 著者名/発表者名: Taisuke Suzuki, Shun Tamura, Hiromi Nakanishi, Mitsuru Tashiro, Naoko K. Nishizawa, Etsuro Yoshimura
  • 雑誌名: Biol. Trace Elem. Res. 120 ページ: 57-263
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal Structure of 2, 3 -Dimethyl-1-isopropylimidazolium Bromide (2007)
  • 著者名/発表者名: Takashi Fujimoto, Masatoshi Kawahata, Masamichi Nakakoshi, Kentaro Yamaguchi, Tomoya Machinami, Hiroko Seki, Keiko Nishikawa and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: Anal. Sci. 23 ページ: x107-x108
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization ofthe malate-aluminum(III) complex using 1H and 27Al NMR spectroscopy (2007)
  • 著者名/発表者名: Mitsuru Tashiro, Kazuo Furihata, Takashi Fujimoto, Tomoya Machinami and Etsuro Yoshimura
  • 雑誌名: Magn. Reson. Chem. 45 ページ: 518-521
  • 査読あり
• [雑誌論文] Observation of multiple intermediates in α-synuclein fibril formation by singular value decomposition analysis (2007)
  • 著者名/発表者名: Tomoaki Kamiyoshihara, Masaki Kojima, Kenji Ueda, Mitsuru Tashiro, and Sakurako Shimotakahara
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 355 ページ: 398-403
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal Structure of 2,3 -Dimethyl-1-propylimidazolium Bromide (2007)
  • 著者名/発表者名: Takashi Fujimoto, Masamichi Nakakoshi, Tomoya Machinami, Hiroko Seki, Keiko Nishikawa and Mitsuru Tashiro
  • 雑誌名: Anal. Sci. 23 ページ: x9-x10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of 1-butyl-3-methylimidazolium iodide (2006)
  • 著者名/発表者名: Masamichi Nakakoshi, Motoo Shiro, Takashi Fujimoto, Tomoya Machinami, Hiroko Seki, Mitsuru Tashiro and Keiko Nishikawa
  • 雑誌名: Chem. Lett. 35 ページ: 1400-1401
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of α,α-trehalose-calcium chloride monohydrate complex (2006)
  • 著者名/発表者名: Takashi Fujimoto, Kazuyuki Oku, Mitsuru Tashiro and Tomoya Machinami
  • 雑誌名: J. Carbohydr. Chem. 25 ページ: 521-532
  • 査読あり
• [学会発表] Practical use of WaterLOGSY and STD Techniques for Observing a Ligand Binding with a Protein Receptor (2009)
  • 著者名/発表者名: 田代 充、降旗一夫、田代櫻子
  • 学会等名: The 50th experimental NMR conference
  • 発表場所: Asilomar, USA
  • 年月日: 20090329-0403
• [学会発表] パーキンソン病原因タンパク質α-synucleinのアミロイド形成機構の解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 笠井恒希、田代充、下高原櫻子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20081209-12
• [学会発表] Water選択励起pulseの開発-新WaterLOGSY法について (2008)
  • 著者名/発表者名: 降旗一夫、田代充、田代櫻子
  • 学会等名: 第47回NMR討論会
  • 発表場所: 筑波
  • 年月日: 20081112-14
• [学会発表] Structural characterization of Ca-1,6-anhydro-beta-maltotriose complex (2008)
  • 著者名/発表者名: 田代充、加藤敏代、坪野浩二、降旗一夫、鴨修、町並智也、藤本崇
  • 学会等名: 日本分析化学会第57年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 20080910-12
• [学会発表] Structural characterization of Rb-1,6-anhydro-β-maltotriose complex (2008)
  • 著者名/発表者名: 田代充、加藤敏代、藤本崇、加藤隆之、鴨修、坪野浩二、町並智也
  • 学会等名: 第69回分析化学討論会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20080515-16
• [学会発表] Improvement of WaterLOGSY techniques for observing a ligand binding with a protein receptor (2008)
  • 著者名/発表者名: 田代 充、降旗一夫、田代櫻子
  • 学会等名: The 49th experimental NMR conference
  • 発表場所: Asilomar,USA
  • 年月日: 20080309-14
• [学会発表] NMR法を用いた1,6-anhydro-β-D-glucopyranoseと金属との相互作用の検討 (2007)
  • 著者名/発表者名: 土屋浩之、田代充、今成司、関宏子
  • 学会等名: 日本分析化学会第56年会
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 20070919-21
• [学会発表] パーキンソン病原因タンパク質α-synucleinのアミロイド線維形成の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 田代充、上吉原智晃、小島正樹、上田健冶、田代櫻子
  • 学会等名: 第68回分析化学討論会
  • 発表場所: 宇都宮
  • 年月日: 20070519-20
• [学会発表] 核磁気共鳴法によるイオン液体1-buty-3-methylimidazolium bromideの分子運動の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 土屋浩之、田代充、木村由美子、中越雅道、今成司、関宏子
  • 学会等名: 日本薬学会第127年会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 20070328-30
• [学会発表] Structural and spectroscopic characterization of malate-aluminum(III)complex (2006)
  • 著者名/発表者名: 田代充、藤本崇、降旗一夫、町並智也、吉村悦郎
  • 学会等名: 第67回分析化学討論会
  • 発表場所: 秋田
  • 年月日: 20060513-14