| 研究課題/領域番号 |
18550152
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 研究機関 | 九州大学 |
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研究代表者 |
麻生 真理子 九州大学, 大学院薬学研究院, 助教 (30201891)
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| 研究分担者 |
宗末 洋 九州大学, 大学院薬学研究院, 教授 (20095897)
片山 勉 九州大学, 大学院薬学研究院, 教授 (70264059)
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| キーワード | スピンラベル / ESR / DNA / ダイナミクス |
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| 研究概要 |
・2-N-tert-ブチルアミノキシル2'-デオキシアデノシン、イノシン(1)、(2)は、これまで6-クロロプリンのリボース誘導体から合成していたが、対応する2'-デオキシ誘導体を原料とし、以前の合成ルートを短縮した。化合物1、2をホスホロアミダイト体へ変換し、自動合成装置を用いてオリゴデオキシヌクレオチドへ導入した。
・分子運動評価のため回転相関時間をESRスペクトルから算出する既存のシミュレーションはTEMPO誘導体評価のため開発されており、化合物1、2への応用が難しいことが分かった。TEMPO誘導体のESRスペクトルの線幅から2Azz値、δ値を算出し、分子運動評価に利用できることから化合物1、2及び4-hydroxylTEMPO(HT)のESRスペクトルをショ糖溶液中で室温から-70℃で測定し、2Azz値、δ値の温度依存性を比較した。HTではδ値が-20から-30℃の間で2から10mTへと大きく変化し、化合物1では-10から-20℃の問で5から7mTへ、化合物2では-20から-30℃の間で5から8mTへと変化し、化合物1、2でもδ値から動きが評価可能であることが示唆された。
・化合物2を組み込んだ15-merの0℃でのESRスペクトルのδ値を算出した。一本鎖では0.57mTであるのに対し、化合物2とシチジンが対合する相補鎖との二重鎖では0.74mTとなり、二重鎖形成による分子運動の低下を示唆した。化合物2とチミジンが対合する相補鎖との二重鎖ではδ=0.71mTとなり、2組の水素結合形成が可能な2とシチジンが対合する二重鎖の方が、安定で動きが遅い事を示唆する結果となった。スペクトル測定条件の最適化、再現性の確認を現在行っており、アデノシン、グアノシンとの対合、化合物1を組み込んだオリゴマー評価を今後行う。
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