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2007 年度 研究成果報告書概要

バクテリオファージゲノムに存在する新奇遺伝子・新機能遺伝子の探索と解析

研究課題

研究課題/領域番号 18570001
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関埼玉大学

研究代表者

定家 義人  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (40000252)

研究分担者 朝井 計  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 准教授 (70283934)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
キーワード枯草菌 / バクテリオファージ / 制限修飾系 / ゲノム解析
研究概要

バクテリオファージは特定の宿主細菌に感染すると、宿主染色体中に溶原化したり、宿主内で複製・増殖し最終的に宿主を溶菌させたりする。溶原化したプロファージ遺伝子はその後変異し、宿主に新たな機能をもたらすこともある。ファージDNA上の遺伝子にコードされた蛋白質の多くは、新奇で機能未知なものがほとんどであり、その中には、新たな機能・構造を有した有用蛋白質が発見されることも充分考えられる。新奇遺伝子の探索・解析を目指して本研究を行った。
枯草菌Marbarg株はSP10ファージの感染に対して耐性であるが、宿主染色体上の2つの部位に変異(nonA・nonB)を生じると、ファージの感染に感受性になる。この現象の解明を端緒として研究を開始した。
nonA・nonBのSP10ファージに対する作用機構を解析するために、SP10ファージゲノムの塩基配列決定を行った。ライブラリ作製のため、複数の制限酵素や超音波により染色体を切断した。それらをプラスミドベクターにクローニングし、塩基配列を決定した。決定した配列を整列化し連結させ、いくつかのコンティグを作成した。現在までに72のコンティグが得られ、全長約108kbのうち90%の合計97,547bpを決定した。Staphylococcus phage K ORFとの相同性がしばしば見られた。現在決定完了を目指している。
ファージの増殖を阻害している枯草菌のプロファージSPβ内の未同定のnonA変異は、SPβを段階的に欠失した枯草菌株を多数作製し、ファージに対する感受性を調べた結果、複数の機構があることが判明した。少なくとも2種類存在し、一方はyon0遺伝子と未同定遺伝子、もう一方はdNDPの還元酵素のホモログであることを突き止めている。yon0遺伝子産物は機能未知遺伝子だが、遺伝子発現を制御している可能性がある。今後の解析が興味深い。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2008 2007

すべて 学会発表 (6件)

  • [学会発表] バクテリオファージSP10の増殖に関するnonA遺伝子の解析2008

    • 著者名/発表者名
      イーリーメン
    • 学会等名
      第2回日本微生物ゲノム学会大会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2008-03-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Analysis of nonA gene which regulates growth of bacteriophage SP102008

    • 著者名/発表者名
      Yee Lee Mien
    • 学会等名
      The 2nd conference of Society of Genome Microbiolgy, Japan
    • 発表場所
      Osaka Univ
    • 年月日
      2008-03-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] バクテリオファージSP10の増殖に関するnonA遺伝子の解析2007

    • 著者名/発表者名
      イーリーメン
    • 学会等名
      日本遺伝学会第79回大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2007-09-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Analysis of nonA gene which regulates growth of bacteriophage SP102007

    • 著者名/発表者名
      Yee Lee Mien
    • 学会等名
      The 79th conference of the genetics Society of Japan
    • 発表場所
      Okayama Univ
    • 年月日
      2007-09-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [学会発表] 枯草菌SPβ及びSP10ファージのゲノム解析2007

    • 著者名/発表者名
      イーリーメン
    • 学会等名
      第1回日本微生物ゲノム学会大会
    • 発表場所
      かずさ
    • 年月日
      2007-03-02
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [学会発表] Genome analysis of SPβ and nonA gene of Bacillus subtilis2007

    • 著者名/発表者名
      Yee Lee Mien
    • 学会等名
      The 1st conference of Society of Genome Microbiolgy, Japan
    • 発表場所
      Kazusa, chiba
    • 年月日
      2007-03-02
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2010-02-04  

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