| 研究概要 |
前年度ミトコンドリアDNA(mtDNA)の全塩基配列を決定したマコンブのゲノム構造をもとに、北海道産コンブ属6種:ホソメコンブ、リシリコンブ、オニコンブ、エナガコンブ、ミツイシコンブ、アツバコンブについて全塩基配列を決定し、構造比較を行なった。
調べられた6種はマコンブと同じく何れも環状構造を示し、その構成は既知のヨーロッパ産Laminaria digitataと殆ど同様であったが、後者に存在する1カ所のOpen Reading Frame(ORF 157)が北海道産7種では認められなかった。塩基長はマコンブ系のホソメコンブ、オニコンブ、エナガコンブがマコンブと同じく何れも37,657bpで全領域を通して塩基の挿入・欠損は無く、一方、リシリコンブでは37,656bpで、前4種との間にrRNA(rps19)に1塩基の挿入・欠損が見られた。これらマコンブ系コンブ5種の中では塩基の変異は乏しかったが、それらのアライメントでは全領域で69サイトに相違が検出され、特にtRNAの2領域:trnL(=1.39)およびtrnM(=1.33)、rRNAの1領域:rps19(0.80)、ORFの1領域:ORF41(0.79)、およびスペーサーの7領域(=0.85-4.00)で高い塩基置換率(>0.50)が示された。また、ミツイシコンブ、アツバコンブの全塩基長はそれぞれ37,604bp、37,500bpであり、マコンブ系コンブに比べてゲノムサイズは幾分小さかった。マコンブ系コンブ内で比較的変異の大きいrps19における塩基の相同率は、マコンブとミツイシコンブの間で96%、マコンブとアツバコンブの間で95%、ミツイシコンブとアツバコンブの間で96%であった。
本研究により遺伝的相違に乏しい北海道産コンブ属植物について、mtDNAの複数領域から変異を検出ですることができ、系統・種分化を推察することができた。
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