シグナル認識粒子の立体構造解析

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18570113
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 千葉工業大学
• 研究代表者: 坂本 泰一 千葉工業大学, 工学部, 准教授 (40383369)
• 連携研究者: 河合 剛太 千葉工業大学, 工学部, 教授 (70211860)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• キーワード: 核酸 / 機能性RNA / NMR / シグナル認識粒子 / 構造生物学 / タンパク質

研究概要

分泌タンパク質を認識して膜外に輸送するシグナル認識粒子(SRP)の立体構造解析を行った.また,SRPを構成するRNAとタンパク質の相互作用解析を行った.全体構造の決定には至らなかったが,RNAの部分構造が明らかとなった. SRPの形成のためにその部分構造が重要であることが示唆された.さらに,RNAの立体構造はタンパク質と相互作用することによって大きく構造変化することが明らかとなった.

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of RNA aptamers against SRP19 protein having sequences different from SRP RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Haraguchi Y., Kuwasako K., Muto Y., Bessho Y., Nishimoto M., Yokoyama S., Kanai A., Kawai G., Sakamoto T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. in press
• [雑誌論文] NMRによるRNAの立体構造解析 (2006)
  • 著者名/発表者名: 坂本泰一
  • 雑誌名: 分光研究 55巻 ページ: 173-181
• [雑誌論文] Solution Structure of a GAAG Tetraloop in Helix 6 of SRP RNA from Pyrococcus furiosus, Nucleosides (2006)
  • 著者名/発表者名: Okada K., Takahashi M, Sakamoto T., Kawai G., Nakamura K., Kanai A.
  • 雑誌名: Nucleotides and Nucleic Acids 25 ページ: 383-395
  • 査読あり
• [学会発表] 超好熱性古細菌Pyrococcus furiosusのSRPの構造解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 助川伸也,岡田潔,高橋真梨,中村幸治,金井昭夫,河合剛太,坂本泰一
  • 学会等名: 平成20年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 群馬大学(桐生)
  • 年月日: 2008-06-21
• [学会発表] 超好熱性古細菌Pyrococcus furiosusのSRPの構造と機能の解析 (2006)
  • 著者名/発表者名: 松田崇志,高橋真梨,越智丈衆,助川伸也,岡田潔,中村幸治,金井昭夫,坂本泰一,河合剛太
  • 学会等名: 第7回極限環境微生物学会年会
  • 発表場所: 明治大学(川崎)
  • 年月日: 2006-11-29
• [図書] 機能性Non-coding RNA (2006)
  • 著者名/発表者名: 河合剛太,坂本泰一
  • 総ページ数: 145-159
  • 出版者: クバプロ