| 研究概要 |
本年度11月23日発行のNature誌において、国際コンソーシャムによるヒト遺伝子コピー数多型(CNV)の全ゲノムを対象とした解析結果が報告され(RedonR.et al.,Nature 2006,444,444-454)、同時にデータが公開された(http://www.sanger.ac.uk/humgen/cnv/data/)。そこで、薬物動態関連遺伝子を対象に、同データベースでCNVの存在の有無の検索を実施した(ヒューピットジェノミクス株式会社に委託)。その結果、対象とした238遺伝子のうち63遺伝子において109個のCNVが見出された。CNVの存在頻度は各CNVによって異なり、1%以下のものから10%を超えるものまで存在した。CNVの存在が確認された遺伝子より、10種の遺伝子について検出プローブの設計に着手した。解析法としてはヒトゲノムDNAにおける各遺伝子のコピー数をRNase Pを対照としたreal-time PCRにてΔΔCt法により測定する予定であるため、TaqMan Chemistryに基づいて設計を行っている。
プローブの設計と並行して、ヒューマンサイエンス研究資源バンクより、日本人由来ヒト不死化B細胞ゲノムDNA100サンプルを購入した。ドナーの構成は20,30,40,50,60歳代の日本人男女各10ドナーずつ、計100ドナーである。当該サンプルの購入に必要な当所倫理委員会の承認は平成17年2月に取得済みである。
以上、初年度は対象とする薬物動態関連遺伝子の絞込みを行い、そのゲノムコピー数を測定する系の設計を開始した。併せて、測定に必要なヒトゲノムサンプルを入手した。二年度目は、実際のコピー数データの収集を100ドナー規模で行い、得られたデータの評価法の検討などを行う予定である。作成したデータベースは、随時最新情報に更新し新規対象遺伝子の絞り込みに活用する。
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