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子宮頸部に感染しているヒトパピローマウイルス(HPV)DNAのL1領域PCR産物についてダイレクトシークエンシングを行い、塩基配列にもとづくハイリスクバリアントの検索を行っている。対象としているHPV DNAの由来は、子宮頸部扁平上皮癌細胞、子宮頸部異形成細胞、子宮頸部細胞診正常例細胞である。HPVの型は、型番のついた既知のもので、これまで6型から91型まで合計31種を同定している。世界的に広く認められるハイリスク型のHPV型として、16型、18型、31型、33型、35型、52型、58型などがあるが、それらには型内バリアントを検出している。
16型については5種類のバリアントが検出されており、そのうち、3種類のバリアントが浸潤癌より検出されている。18型については4種類のバリアントが検出されており、すべてのバリアントが浸潤癌より検出されている。31型については2種類のバリアントが検出されており、そのうち1種類が浸潤癌より検出されている。33型については2種類のバリアントが検出されており、そのうち、1種類が浸潤癌より検出されている。35型については3種類のバリアントが検出されており、そのうち、1種類が浸潤癌より検出されている。52型については5種類のバリアントが検出されており、そのうち、3種類が浸潤癌より検出されている。58型については2種類のバリアントが検出されているが、その両方が浸潤癌より検出されている。
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