| 研究課題/領域番号 |
18658063
|
|---|
| 研究機関 | 東京大学 |
|---|
研究代表者 |
練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)
|
|---|
| 研究分担者 |
宝月 岱造 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (10107170)
|
|---|
| キーワード | マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー / 育種学 / 分子生態学 / 集団遺伝学 |
|---|
| 研究概要 |
平成19年度は主に以下のような結果が得られた。
1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。
樹木:カワクルミ
動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ
草本:レンゲショウマ、フジアザミ
クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の研究グループにもこの方法を利用して短時間で多型性の高い複合SSRマーカー作製に成功した。
2)複合SSRマーカーが得るために、更に簡便な作製方法:inter-compound-SSR(ICSSR)法を考案した。この方法では、ゲノムDNAからICSSR領域を1回PCRで増幅し、sub-cloning後塩基配列を1回決定するだけて共優性多型マーカーを作製できる。この方法を用いて、アジアザミ、マテバシイ、ヌルデから多型性のあるSSRマーカをそれぞれ10、7、9座作製した。
|
