AFLP解析を用いた東北地方高山帯フロラにおけるボトルネック効果の検証

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18770067
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 熊本大学 (2007-2008); 首都大学東京 (2006)
• 研究代表者: 藤井 紀行 熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 准教授 (40305412)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• キーワード: マイクロサテライト解析 / 日本産高山植物 / 集団遺伝学的解析 / 遺伝的多様性評価

研究概要

日本列島の東北地方高山帯におけるボトルネック効果や創始者効果といった過去の集団サイズの縮小・拡大を推定するために、エゾシオガマ(Pedicularis yezoensis,ゴマノハグサ科)のマイクロサテライトマーカーの開発を行い、集団間の遺伝的多様性の比較を行った。また予備的な結果ではあるが、東北集団が北海道集団、本州中部集団に比べて低い傾向が見られた。この結果は、東北地方の集団において過去に創始者効果、もしくはボトルネック効果が働いたことを支持するものである。

研究成果

• [雑誌論文] Survival and genetic divergence of an arctic-alpine plant, Diapensia lapponica subsp. obovata(Fr. Schm.) Hulten(Diapensiaceae), in the high mountains of central Japan during climatic oscillations (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, H. Setoguchi
  • 雑誌名: Plant Systematics and Evolution 272 ページ: 197-210
  • 査読あり
• [雑誌論文] Consistent geographic structure among multiple nuclear sequences and cpDNA polymorphisms of Cardamine nipponica Franch (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, H. Setoguchi
  • 雑誌名: et Savat.(Brassicaceae). Molecular Ecology 17 ページ: 3178-3188
  • 査読あり
• [雑誌論文] Post-glacial range fragmentation is responsible for the current distribution of Potentilla matsumurae Th. Wolf (Rosaceae) in the Japanese archipelago (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, and H. Setoguchi
  • 雑誌名: Journal of Biogeography 35 ページ: 791-800
  • 査読あり
• [雑誌論文] 日本産高山植物における本州中部地域の系統地理学的重要性 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行
  • 雑誌名: 第一回日本植物分類学会奨励賞受賞記念論文 8 ページ: 5-14
• [雑誌論文] Chloroplast DNA phylogeography of Pedicularis ser. Gloriosae (Orobanchaceae) in Japan (2007)
  • 著者名/発表者名: Fujii, N
  • 雑誌名: J. Plant Res 120 ページ: 491-500
  • 査読あり
• [雑誌論文] Refugia of Potentilla matsumurae (Rosaceae) located at high mountains in the Japanese archipelago (2006)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, H., K. Senni, N. Fujii, and H. Setoguchi
  • 雑誌名: Molecular Ecology 15 ページ: 3731-3740
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of chloroplast DNA haplotypes in the contact zone of Fagus crenata in the southwest of Kanto District, Japan (2006)
  • 著者名/発表者名: Kobashi, S., N. Fujii, A. Nojima, N. Hori
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 119 ページ: 265-269
• [雑誌論文] Phylogeography of Japanese alpine plants : biogeographic importance of alpine region of central Honshu in Japan (2006)
  • 著者名/発表者名: Fujii, N. and K. Senni
  • 雑誌名: Taxon 55 ページ: 43-52
  • 査読あり
• [雑誌論文] サハリン植物紀行 (2006)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行
  • 雑誌名: 分類 6 ページ: 151-155
• [雑誌論文] ブナの地理的変異研究と今後の展望(Areview of studies on geographical variation in Fagus crenata and future prospects) (2006)
  • 著者名/発表者名: 小橋寿美子・藤井紀行・岡秀一
  • 雑誌名: 長野県植物研究会誌 40 ページ: 207-213
• [学会発表] 阿蘇山系における絶滅危惧植物の現状と保全活動 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行・瀬井純雄
  • 学会等名: 第56回日本生態学会大会
  • 発表場所: 岩手県立大学
  • 年月日: 2009-03-19
• [学会発表] 分子データからみた東北地方の高山フロラの成立過程 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行
  • 学会等名: 日本植物分類学会第8回大会公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京エレクトロンホール宮城
  • 年月日: 2009-03-15
• [学会発表] ミヤマタネツケバナ(Cardamine nipponica)のPHYE光センサードメインにおける南北間での適応分化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池田啓・藤井紀行・瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物学会第72回大会
  • 発表場所: 高知大学
  • 年月日: 20080925-27
• [学会発表] ブナの地理的変異と広葉樹種苗 (2008)
  • 著者名/発表者名: 高橋誠・平岡宏一・後藤晋・原正利・藤井紀行、以下4名省略
  • 学会等名: 第120回日本森林学会大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 20080325-27
• [学会発表] 葉緑体DNAを用いたハンカイシオガマ列植物(ゴマノハグサ科)の分子系統地理学的解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行
  • 学会等名: 日本植物分類学会第7回大会
  • 発表場所: 首都大学東京
  • 年月日: 20080320-23
• [学会発表] イワタバコ類の種分類学的研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 宮なろう・藤井紀行・桜澤裕樹・村上哲明
  • 学会等名: 日本植物分類学会第7回大会
  • 発表場所: 首都大学東京
  • 年月日: 20080320-23
• [学会発表] 複数遺伝子座からみたミヤマタネツケバナ(Cardamine nipponica)の分断分布と進化史 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池田啓・仙仁径・藤井紀行・瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物分類学会第7回大会
  • 発表場所: 首都大学東京
  • 年月日: 20080320-23
• [学会発表] 葉緑体SNPによるブナの系統地理学的な研究-分布域全体をほぼ網羅したハプロタイプ地図の作成 (2008)
  • 著者名/発表者名: 高橋誠・原正利・藤井紀行、以下24名省略
  • 学会等名: 日本生態学会第55回大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 20080314-17
• [学会発表] Chloroplast DNA phylogeography of Pedicularis resupinata (Scrophulariaceae) around the Japanese Islands (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujii, N.
  • 学会等名: International symposium on East Asian plant diversity and conservation
  • 発表場所: Hokkaido University, Sapporo, Japan
  • 年月日: 2008-08-02
• [学会発表] アブラナ科ミヤマタネツケバナの遺伝構造と地理的構造 (2007)
  • 著者名/発表者名: 池田啓・仙仁径・藤井紀行・瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物学会第71回大会
  • 発表場所: 東京理科大学
  • 年月日: 20070906-09
• [学会発表] 日本産高山植物の比較系統地理 (2007)
  • 著者名/発表者名: 池田啓・仙仁径・藤井紀行・清水健太郎・瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本生態学会大54回大会
  • 発表場所: 愛媛大学
  • 年月日: 20070319-23
• [学会発表] 本州中部産ヨツバシオガマの分類学的再検討 (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行・植田邦彦・綿野泰行
  • 学会等名: 日本植物分類学会第6回大会
  • 発表場所: 新潟大学
  • 年月日: 20070314-17
• [学会発表] 日本産高山植物における本州中部地域の系統地理学的重要性(奨励賞受賞講演) (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行
  • 学会等名: 日本植物分類学会第6回大会
  • 発表場所: 新潟大学
  • 年月日: 20070314-17
• [学会発表] 高山植物ミヤマキンバイ(バラ科)の系統地理 (2006)
  • 著者名/発表者名: 池田啓・仙仁径・藤井紀行・瀬戸口浩彰
  • 学会等名: 日本植物学会第70回大会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 20060913-16
• [学会発表] 日本産高山植物エゾシオガマの葉緑体DNAの地理的変異 (2006)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行・仙仁径・菅原敬・若林三千男
  • 学会等名: 日本植物学会第70回大会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 20060913-16
• [図書] 進化し続ける植物たち(葛西奈津子著・日本植物生理学会監修)のトピックとして (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井紀行
  • 総ページ数: 133-135
  • 出版者: 日本の高山植物を見つめて
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/bio/staff/fujii/Fujii_HP/index.html