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2006 年度 実績報告書

藍藻ホスホリブロキナーゼのX線構造解析による反応機構と活性制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18770087
研究機関大阪大学

研究代表者

松村 浩由  大阪大学, 大学院工学研究科, 助手 (30324809)

キーワード藍藻 / ホスホリブロキナーゼ / X線構造解析 / 反応機構 / 活性制御機構
研究概要

本研究は、カルビンサイクルを構成している酵素の一つである藍藻ホスホリブロキナーゼ(PRK)の反応機構ならびに活性調節機構をX線構造解析によって解明することを目的とし、以下の実験を行った。
藍藻Synecococcus由来PRKの大量培養系(BL21(DE3)plysS/pET16b)を構築した。精製手順は、藍藻PRKを大量に生産した大腸菌を破砕し、硫安分画、Niアフィニティークロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィーで精製を行った。その後、動的溶液光散乱法装置(DLS)を用いて、溶液状態でのサンプルの結晶化能を確認した。続いて、His-tagドメインを有した酵素を用いて、結晶化を行った。恒温インキュベータ(20℃と4℃)で、種々の結晶化条件の検討を行ったところ、PEG3350とisopropanolを沈殿剤として用いた条件で、0.2x0.2x0.2mm程度のX線回折実験に適した大きさの単結晶を作成することに初めて成功した。しかしながら、大型放射光施設SPring-8にてX線回折実験を行ったところ回折能3.8Å程度と、回折強度データの若干の改良が見られたものの、構造解析には不十分であった。次に、His-tagドメインが高品質結晶の育成を妨げている可能性を考慮し、ThrombinによってHis-tagドメインを切断し、さらに、PRKの本体をゲル櫨過クロマトグラフィーにより精製した。その後、結晶化を行ったところ、0.05mm程度の単結晶を作成することに成功したが、大きさが不十分であるため、更なる結晶の品質向上を自指し、溶液状態制御による品質向上を試みている。また、同時に、PRKの活性調節因子であるCP12タンパク質の発現系の構築にとりくみ、PRKとCP12の結合の確認をpull-down assayにて確認した。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (5件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction study of glycerol kinase from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis2007

    • 著者名/発表者名
      R.Katsumi, Y.Koga, D.-J.You, H.Matsumura, K.Takano, S.Kanaya
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F 63巻2号

      ページ: 126-129

  • [雑誌論文] A novel mechanism of allosteric regulation of archaeal phosphoenolpyruvate carboxylase : a combined approach to structure-based alignment and model assessment2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Matsurmura, Katsura Izui, Kenji Mizuguchi
    • 雑誌名

      Protein engineering design & selection 19巻9号

      ページ: 409-419

  • [雑誌論文] Application of Femtosecond Laser Ablation for Detaching Grown Protein Crystals from a Glass Capillary Tube2006

    • 著者名/発表者名
      M.Kashii, R.Fujisawa, H.Adachi, Y.Mori, T.Sasaki, Y.Koga, K.Takano, S.Kanaya, H.Matsumura, T.Inoue, S.Murakami, K.Sugamoto, H.Yoshikawa
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102巻4号

      ページ: 372-374

  • [雑誌論文] Effect of ultrasonic irradiation on protein crystallization2006

    • 著者名/発表者名
      K.Kakinouchi, H.Adachi, H.Matsumura, T.Inoue, S.Murakami, Y.Mori, Y.Koga, K.Takano, S.Kanaya
    • 雑誌名

      Journal of Crystal Growth 292巻2号

      ページ: 437-440

  • [雑誌論文] Cooling-rate screening system for determining protein crystal growth conditions2006

    • 著者名/発表者名
      R.Murai, S.Nakata, M.Kashii, H.Adachi, A.Niino, K.Takano, H.Matsumura, S.Murakami, T.Inoue, Y.Mori, T.Sasaki
    • 雑誌名

      Journal of Crystal Growth 292巻2号

      ページ: 433-436

  • [図書] Structural Biology of Membrane Proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Fabien Walas, Hiroyoshi Matsumura, Ben Luisi
    • 総ページ数
      24
    • 出版者
      Royal Society of Chemistry (RSC)
  • [図書] 第5版 実験化学講座 5 化学実験のための基礎技術2006

    • 著者名/発表者名
      井上 豪, 松村浩由, 甲斐 泰
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      丸善株式会社
  • [図書] 酵素工学ニュース2006

    • 著者名/発表者名
      安達宏昭, 森勇介, 佐々木孝友, 高野和文, 松村浩由, 井上豪, 村上聡
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      酵素工学研究会

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公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

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