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2007 年度 実績報告書

EST情報を活用したスギ雄性不稔原因遺伝子の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18780123
研究機関独立行政法人森林総合研究所

研究代表者

二村 典宏  森林総合研究所, 生物工学研究領域, 主任研究員 (80343804)

キーワードスギ / 雄花 / 花粉形成 / 遺伝子
研究概要

本研究は、スギEST情報を利用して雄性不稔性に関わる遺伝子を特定することを目的としている。昨年度、モデル植物で報告されている雄性不稔原因遺伝子等の情報とスギESTの相同性検索から、スギの雄性不稔候補遺伝子を選抜したが、最終的に少数の遺伝子にまで絞り込むことはできなかった。そのため、本年度は雄花で発現する遺伝子情報をできる限り多く収集し、得られたEST情報をもとにマイクロアレイを作製した。これにより、雄花で発現する遺伝子の網羅的解析による候補遺伝子の抽出が行えるようになった。現在、正常個体と雄性不稔個体の雄花で発現する遺伝子の網羅的な比較解析を進めている。
本年度の研究実績は以下の通りである。
1.スギ雄花に由来するEST情報の充実と、既知のEST情報との統合
異なる発達段階のスギ雄花に由来する完全長cDNAライブラリーからESTを収集した。これまでに報告されたものも含む総計56,000以上のスギESTの統合作業を行った結果、22,882のクラスタ配列にまとめられた。
2.DNAマイクロアレイの設計
22,882のクラスタ配列の塩基配列情報をもとに、各クラスタ配列に対応する複数の60merオリゴヌクレオチドプローブを設計し、DNAマイクロアレイを構築した。
3.DNAマイクロアレイ解析を用いた正常個体と雄性不稔個体の雄花における発現遺伝子の比較
9月下旬(花粉母細胞期)、10月中旬(減数分裂・四分子期)、11月初め(小胞子期)に、正常個体と雄性不稔個体の雄花から抽出したRNAを用いて、マイクロアレイによる発現遺伝子の網羅的解析を現在進めている。これにより、雄性不稔個体と正常個体の花粉発達過程で発現量の異なる遺伝子が明らかになり、雄性不稔性に関わる遺伝子を絞り込むことができると期待される。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Characterization of genes for a pollen allergen, Cry j 2,of Czyptomeria japonica.2007

    • 著者名/発表者名
      Norihiro Futamura
    • 雑誌名

      International Archives of Allergy and Immunology 143

      ページ: 59-68

    • 査読あり
  • [学会発表] スギ雄性不稔家系の花粉発達過程に発現する遺伝子の網羅的解析2008

    • 著者名/発表者名
      二村典宏
    • 学会等名
      日本森林学会
    • 発表場所
      東京農工大学
    • 年月日
      2008-03-28
  • [学会発表] スギ雄花で発現する遺伝子群の解析2007

    • 著者名/発表者名
      二村典宏
    • 学会等名
      日本森林学会
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2007-04-02

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公開日: 2010-02-04   更新日: 2016-04-21  

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