温度制御による結晶化を利用したDNA薬剤に関するX線結晶解析

2008 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 18790030
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 物理系薬学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 茶竹 俊行 京都大学, 原子炉実験所, 准教授 (30383475)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• キーワード: 物理化学

研究概要

本研究の目的は、独自に開発した温度制御による結晶化法を用いることによりDNA のX 線結晶解析の効率を飛躍的に向上させ、構造に基づいた核酸系薬剤のドラッグデザインへの基盤を確立することにある。今回の研究では、(1)温度制御結晶化法を結晶成長学的な観点から実証して、(2)これに基づいたB 型・Z 型DNA の結晶化と高分解能X 線結晶構造解析を行い、(3)薬剤設計の基本となる特殊なDNA (デオキシ型リボザイム・ミニヘアピンDNA・ボロン化合物を導入したDNA)の結晶化を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Functional aberration of myofibrils by cardiomyopathy-causing mutations in the coiled-coil region of the troponin-core domain (2009)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto F, Maeda K, Chatake T, Maeda Y, Fujiwara S
  • 雑誌名: Biochem BioPhys Research Communication 382 ページ: 205-209
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydrogen bonds of DsrD protein revealed by neutron crystallography (2008)
  • 著者名/発表者名: Chatake T, Higuchi Y, Mizuno N, Tanaka I, Niimura N, Morimoto Y
  • 雑誌名: Journal of Synchrotron Radiation 15 ページ: 277-280
  • 査読あり
• [雑誌論文] An abnormal pK(a) value of internal histidine of the insulin molecule revealed by neutron crystallographic analysis (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa T, Chatake T, Morimoto Y, Maeda M, Kurihara K, Tanaka I, Niimura N
  • 雑誌名: Biochem BioPhys Research Communication 376 ページ: 32-35
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preliminary time-of-flight neutron diffraction study of human deoxyhemoglobin (2008)
  • 著者名/発表者名: Kovalevsky AY, Chatake T, Shibayama N, Park SY, Ishikawa T, Mustyakimov M, Fisher SZ, Langan P, Morimoto Y
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F64 ページ: 270-273
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protonation states of buried histidine residues in human deoxyhemoglobin revealed by neutron crystallography (2007)
  • 著者名/発表者名: Chatake T, Shibayama N, Park SY, Kurihara K, Tamada T, Tanaka I, Niimura N, Kuroki R, Morimoto Y
  • 雑誌名: Journal of American Chemical Society 129 ページ: 14840-14841
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protocol of refinement in neutron crystallographic analysis (2007)
  • 著者名/発表者名: Chatake T, Morimoto Y
  • 雑誌名: 日本中性子科学会誌 17 ページ: 216-217
• [学会発表] (2009)
  • 著者名/発表者名: 茶竹俊行
  • 学会等名: 温度制御によるDNA の結晶化とその応用タンパク質結晶育成研究会
  • 発表場所: 東海村(茨城県)
  • 年月日: 2009-03-06
• [学会発表] (2008)
  • 著者名/発表者名: Chatake, Ishikawa, Morimoto
  • 学会等名: Crystal Structures of Z-DNA complexed with Ca2+ ion, and Mg2+ ion XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: 大阪市(大阪府)
  • 年月日: 2008-08-25
• [学会発表] 金属イオンがDNA構造に与える影響 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石川卓哉・森本幸生・茶竹俊行
  • 学会等名: 日本結晶学会年会
  • 発表場所: 東京都
  • 年月日: 2007-12-02