| 研究概要 |
研究計画に沿って、まず既報の疾患関連遺伝子について本研究計画で使用する集団での追認試験を行った。各遺伝子上の責任遺伝子変異のジェノタイピングを、ABI PRISM 7900HT(アプライドバイオシステムズ社)およびGeneAmp PCR System 9700(同)を利用し、TaqMan法を用いて行った。タイピング後にχ二乗検定、ハプロタイプ解析などの遺伝統計解析によりRAとの関連を確認し、関連を認めたものや、認めなかったものがあった。このうちのいくつかについては論文として研究報告を行っている。
PADI4は日本人で強い関連を認める疾患関連遺伝子であり、当施設でのサンプルでも関連を確認できた。しかし、白色人種を用いた検討では関連を認めないという報告が相次いだ。これを検証するために白色人種5集団に日本人を含めたメタ解析を行って、白色人種単独でも関連を認めることを確認し、PADI4が人種を超えた疾患関連遺伝子であることを証明した。
PTPN22はPADI4とは逆に白色人種で強い関連を認めるものの,日本人では責任変異に多型性を認めない遺伝子である。PTPN22が日本人で真に関連しないことを示すためにHapMapを用いて選択したTag SNPを用いて、広範な解析を行い、日本人においてPTPN22は関連遺伝子でないことを示した。
MHC2TAは欧米で確認された疾患感受性遺伝子である。当施設でのサンプルを用いて解析を行い、むしろ日本人でより強く関連することを示した。
FCRL3は日本で報告された疾患感受性遺伝子であり、当施設のサンプルでもその関連が確認できた。
今後さらに研究を進め、関連が確認された遺伝子については遺伝子間相互作用、遺伝子-環境間相互作用の解析に利用する。
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