• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2006 年度 実績報告書

糖尿病性腎症に対する新規創薬ターゲットの同定:網羅的pathway・転写機構解析

研究課題

研究課題/領域番号 18890082
研究機関名古屋大学

研究代表者

安田 宜成  名古屋大学, 大学院医学系研究科, 研究員 (60432259)

キーワードDNAアレイ / 糖尿病性腎症 / バイオインフォマティクス
研究概要

糖尿病性腎症は末期腎不全に至る最大の原疾患であるが、その病態解明は不充分である。ヒト糖尿病性腎症(DN)13例の腎生検組織を糸球体と尿細管間質領域にmicrodisectionし、後者をAffymetrix社のDNA array(HGUA133)により、網羅的遺伝子発現解析を行った。対照は生体腎移植ドナー(LD)7例、微小変化型ネフローゼ(MCNS)4例で、統計学的解析(RMA, SAM)によりFDR<1%を有意な発現変動と定義した。バイオインフォマティクス解析として、clustering解析、GeneOntologyChart解析(DAVID)、Pathway解析(Ingenuity)、転写機構解析(Genomatix)を行った。Clustering解析でearly DN(eDN)はprogressive DN(pDN)とは異なった遺伝子発現を示し、LDやMCNSとの類似性を認めた。GeneOntologyChart解析でpDNは炎症に関連する遺伝子群が発現変化し、Pathway解析ではNF-κB pathwayが活性化していた。転写機構解析によりNFKB_IRFF_01 moduleの関与を同定、本moduleに制御され得る9個の遺伝子(B2M, CCL5/RANTES, CXCL10/IP10,EDN1,HLA-A, HLA-B, IFNB1,VCAM1)発現亢進を予測し、9個全ての遺伝子発現亢進をRT-PCR法等により確認した。本研究は、DNの進展へのNF-κBとIRFの関与を明らかにし、新たな創薬ターゲット検索の端緒となるのみならず、DNなどの複雑な病態をDNA arrayとバイオインフォマティクス解析により解明し得ることを示唆するものである。本成果は、米国腎臓学会と日本腎臓学会において筆頭著者として発表、連名筆頭著者としてDiabetes誌に報告した。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (3件)

  • [雑誌論文] Interstitial Vascular Rarefaction and Reduced VEGF-A Expression in Human Diabetic Nephropathy2007

    • 著者名/発表者名
      Lindenmeyer MT, Kretzler M, Boucherot A, Berra S, Yasuda Y et al.
    • 雑誌名

      Journal of American Society of Nephrology (in press)

  • [雑誌論文] Gene expression profiling analysis in nephrology : towards molecular definition of renal disease.2006

    • 著者名/発表者名
      Yasuda Y, Cohen CD, Henger A et al.
    • 雑誌名

      Clinical and Experimental Nephrology 10(2)

      ページ: 91-98

  • [雑誌論文] Modular activation of nuclear factor-kappaB transcriptional progra ms in human diabetic nephropathy.2006

    • 著者名/発表者名
      Schmid H, Boucherot A, Yasuda Y et al.
    • 雑誌名

      Diabetes 55(11)

      ページ: 2993-3003

URL: 

公開日: 2008-05-08   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi